More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2010 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  100 
 
 		 450 aa  915    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  54.13 
 
 		 484 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  54.85 
 
 		 484 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  53.93 
 
 		 484 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  54.13 
 
 		 484 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  53.17 
 
 		 490 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  52.76 
 
 		 490 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  52.56 
 
 		 489 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  52.97 
 
 		 490 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  56.49 
 
 		 461 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  54.68 
 
 		 457 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  52.16 
 
 		 488 aa  478  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  53.61 
 
 		 455 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2404  putative chaperone  52.56 
 
 		 468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000139082  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  53.98 
 
 		 456 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2656  putative chaperone  55.46 
 
 		 459 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  45.07 
 
 		 454 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  46.36 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  45.25 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  45.73 
 
 		 450 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  45.73 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  45.73 
 
 		 450 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  45.73 
 
 		 450 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  45.03 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  45.51 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  45.73 
 
 		 450 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  45.73 
 
 		 450 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  44.08 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  45.73 
 
 		 450 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  45.05 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  45.51 
 
 		 450 aa  372  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1614  putative chaperone  45.93 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  44.57 
 
 		 450 aa  359  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  44.79 
 
 		 450 aa  358  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  44.79 
 
 		 450 aa  358  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  43.49 
 
 		 450 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  43.49 
 
 		 450 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  43.49 
 
 		 450 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  43.49 
 
 		 450 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  40.49 
 
 		 452 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  41.61 
 
 		 450 aa  341  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  43.38 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  42.24 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  42.8 
 
 		 450 aa  330  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  37.66 
 
 		 475 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  35.45 
 
 		 418 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2983  putative heat shock protein 70 family protein  33.93 
 
 		 501 aa  209  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0515  putative heat shock protein 70 family protein  30.85 
 
 		 437 aa  208  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.733871 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00220  putative heat shock protein 70 family protein  34.54 
 
 		 500 aa  199  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  35.26 
 
 		 419 aa  196  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  35.44 
 
 		 421 aa  189  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  35.88 
 
 		 425 aa  186  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  34.66 
 
 		 425 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  34.66 
 
 		 418 aa  182  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  33.16 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  35.53 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  30.79 
 
 		 417 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  31.02 
 
 		 417 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  32.08 
 
 		 421 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  31.93 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  32.97 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  30.3 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  33.24 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  33.24 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  32.24 
 
 		 423 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  33.85 
 
 		 421 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  33.83 
 
 		 421 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  31.27 
 
 		 421 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  32.8 
 
 		 424 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  30.85 
 
 		 419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  30.26 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  31.61 
 
 		 415 aa  159  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  31.99 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  29.17 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  32.84 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  29.14 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  32.88 
 
 		 415 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2937  heat shock protein  30.08 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  28.48 
 
 		 496 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  28.26 
 
 		 430 aa  149  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  28.51 
 
 		 416 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  28.04 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  32.05 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  31.54 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  28.51 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  28.51 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  31.54 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1615  heat shock protein  31.73 
 
 		 503 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  28.7 
 
 		 422 aa  147  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  28.24 
 
 		 428 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  32.08 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  32.08 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  32.08 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  32.08 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  32.08 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  31.78 
 
 		 420 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  31.78 
 
 		 577 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01756  heat shock protein  32.3 
 
 		 458 aa  141  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.322701  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  28.57 
 
 		 416 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  29.98 
 
 		 443 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>