More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2728 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  78.38 
 
 
420 aa  661    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  100 
 
 
422 aa  851    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  78.38 
 
 
577 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  77.2 
 
 
416 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  76.96 
 
 
496 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  77.43 
 
 
471 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  85.75 
 
 
416 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  78.38 
 
 
420 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  76.96 
 
 
416 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  77.2 
 
 
416 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  76.48 
 
 
435 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  77.2 
 
 
416 aa  648    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  78.38 
 
 
420 aa  661    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  85.99 
 
 
416 aa  713    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  78.38 
 
 
420 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  78.38 
 
 
420 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  79.1 
 
 
420 aa  668    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  76.48 
 
 
422 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  69.12 
 
 
416 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  58.29 
 
 
438 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  55.24 
 
 
432 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  46.65 
 
 
420 aa  356  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  46.94 
 
 
420 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  45.69 
 
 
421 aa  351  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  47.41 
 
 
425 aa  349  6e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  47.28 
 
 
417 aa  348  8e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  46.93 
 
 
417 aa  346  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  45.65 
 
 
425 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  47.28 
 
 
417 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  46.94 
 
 
416 aa  341  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  48.78 
 
 
443 aa  338  8e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  43.54 
 
 
421 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  45.86 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  43.3 
 
 
421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  43.54 
 
 
423 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  43.54 
 
 
423 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  43.54 
 
 
424 aa  334  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  43.3 
 
 
423 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  43.54 
 
 
421 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  44.02 
 
 
419 aa  330  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  44.44 
 
 
415 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  45.45 
 
 
421 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  44.21 
 
 
437 aa  322  8e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  44.1 
 
 
415 aa  319  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  41.47 
 
 
417 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  46.7 
 
 
418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  38.42 
 
 
428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  43.1 
 
 
419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  43.3 
 
 
421 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  40.91 
 
 
418 aa  298  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  41.84 
 
 
415 aa  290  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  37.05 
 
 
419 aa  289  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  44.66 
 
 
415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  43.06 
 
 
421 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  36 
 
 
420 aa  203  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  32 
 
 
425 aa  193  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  34.52 
 
 
412 aa  192  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  32.94 
 
 
423 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  36.45 
 
 
414 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  36.45 
 
 
414 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  30.81 
 
 
425 aa  183  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  36.99 
 
 
412 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  31.45 
 
 
452 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  30.12 
 
 
423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  29.38 
 
 
425 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  34.71 
 
 
428 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  26.34 
 
 
454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  29.34 
 
 
450 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  29.35 
 
 
456 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  30.87 
 
 
455 aa  170  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  28.7 
 
 
456 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  30.19 
 
 
475 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  30.69 
 
 
456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  27.32 
 
 
421 aa  167  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  33.86 
 
 
430 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  29.03 
 
 
450 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  30.24 
 
 
450 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  29.03 
 
 
450 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  29.03 
 
 
450 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  29.03 
 
 
450 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  27.23 
 
 
450 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  29.52 
 
 
450 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  31.24 
 
 
418 aa  160  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  29.66 
 
 
457 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  31.16 
 
 
449 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  30.89 
 
 
450 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  30.49 
 
 
440 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  29.1 
 
 
490 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  30.89 
 
 
450 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  30.89 
 
 
450 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  28.86 
 
 
489 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  29.35 
 
 
490 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  29.35 
 
 
490 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  28.23 
 
 
450 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  28.23 
 
 
450 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  28.23 
 
 
450 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  28.23 
 
 
450 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  28.23 
 
 
450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  28.23 
 
 
450 aa  154  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  28.23 
 
 
450 aa  154  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.232925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>