More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4898 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  84.56 
 
 		 423 aa  729    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  100 
 
 		 421 aa  865    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  96.44 
 
 		 421 aa  835    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  87.89 
 
 		 424 aa  764    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  84.56 
 
 		 423 aa  729    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  76.25 
 
 		 421 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  84.56 
 
 		 423 aa  727    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  72.68 
 
 		 421 aa  642    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  77.67 
 
 		 421 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  84.09 
 
 		 421 aa  721    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  78.15 
 
 		 421 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  57.93 
 
 		 425 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  57.35 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  56.94 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  56.25 
 
 		 419 aa  484  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  56.28 
 
 		 425 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  54.83 
 
 		 417 aa  477  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  55.21 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  54.94 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  48.56 
 
 		 419 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  46.14 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  46.97 
 
 		 418 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  45.26 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  45.26 
 
 		 415 aa  355  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  45.74 
 
 		 415 aa  353  4e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  45.17 
 
 		 415 aa  352  7e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  43.7 
 
 		 420 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  46.12 
 
 		 415 aa  339  5e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  42.72 
 
 		 496 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  44.5 
 
 		 416 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  42.55 
 
 		 420 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  42.24 
 
 		 435 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  42.55 
 
 		 420 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  42.38 
 
 		 577 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  42.55 
 
 		 420 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  42.55 
 
 		 420 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  42.55 
 
 		 420 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  42.55 
 
 		 420 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  42.37 
 
 		 416 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  43.36 
 
 		 422 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  43.23 
 
 		 416 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  43.23 
 
 		 416 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  41.65 
 
 		 471 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  42.99 
 
 		 416 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  38.89 
 
 		 428 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  43.3 
 
 		 422 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  42.37 
 
 		 416 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  42.37 
 
 		 416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  43.17 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  38.55 
 
 		 419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  39.71 
 
 		 416 aa  312  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  40.38 
 
 		 438 aa  300  5e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  43.21 
 
 		 418 aa  290  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  37.65 
 
 		 432 aa  282  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  32.82 
 
 		 450 aa  233  7.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  32.82 
 
 		 450 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  32.82 
 
 		 450 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  34.52 
 
 		 420 aa  230  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  35.39 
 
 		 452 aa  219  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  31.72 
 
 		 450 aa  219  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  29.19 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  31.72 
 
 		 423 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  32.69 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  33.98 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  34.35 
 
 		 412 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  35.45 
 
 		 414 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  31.96 
 
 		 425 aa  206  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  36.3 
 
 		 428 aa  206  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  34.96 
 
 		 414 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  30.49 
 
 		 456 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  32.45 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  32.49 
 
 		 440 aa  203  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  30.72 
 
 		 456 aa  202  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  31.96 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  30.2 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  29.75 
 
 		 450 aa  200  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  34.57 
 
 		 430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  30.87 
 
 		 450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  29.06 
 
 		 421 aa  196  8.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  29.27 
 
 		 490 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  29.46 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  29.46 
 
 		 450 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  29.27 
 
 		 489 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  29.46 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  29.46 
 
 		 450 aa  195  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  29.24 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  29.4 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  29.24 
 
 		 450 aa  193  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  28.92 
 
 		 490 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  29.4 
 
 		 450 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  29.46 
 
 		 450 aa  193  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232925 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  29.02 
 
 		 450 aa  192  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  29.4 
 
 		 450 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  29.4 
 
 		 450 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  29.12 
 
 		 490 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  29.02 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  27.87 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  28.48 
 
 		 484 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  27.66 
 
 		 484 aa  189  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  28.95 
 
 		 450 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>