More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4252 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  800    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  77.59 
 
 		 414 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  77.83 
 
 		 414 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  65.85 
 
 		 412 aa  494  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  53.41 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  41.81 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  41.63 
 
 		 415 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  41.81 
 
 		 415 aa  237  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  42.86 
 
 		 415 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  34.7 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  40.57 
 
 		 415 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  35.02 
 
 		 419 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  39.36 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  38.57 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  33.88 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  37.65 
 
 		 425 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  36.32 
 
 		 420 aa  220  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  37.07 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  37.38 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  38.01 
 
 		 416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  34.35 
 
 		 421 aa  216  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  35.63 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  35.75 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  35.75 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  35.51 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  38.85 
 
 		 443 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  38.08 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  35.77 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  34.78 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  35.77 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  35.52 
 
 		 423 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  35.44 
 
 		 421 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  36.08 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  36.47 
 
 		 435 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  36.71 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  35.77 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  36.78 
 
 		 471 aa  199  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  35.77 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  35.66 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  36.23 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  35.52 
 
 		 416 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  35.35 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  35.29 
 
 		 438 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  36.93 
 
 		 418 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  36.5 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  35.99 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  35.99 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  35.99 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  35.99 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  35.99 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  35.99 
 
 		 577 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  34.55 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  37.29 
 
 		 416 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  35.49 
 
 		 421 aa  189  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  35.52 
 
 		 416 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  36.99 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  34.84 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  35.77 
 
 		 416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  34.77 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  27.62 
 
 		 423 aa  155  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  25.83 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  26.14 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  27.73 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  32.24 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  27.82 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0674  HSP70 family molecular chaperone  33.8 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  28.17 
 
 		 425 aa  142  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1615  molecular chaperone-like protein  32.77 
 
 		 424 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1690  molecular chaperone-like protein  33.41 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  27.36 
 
 		 424 aa  135  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  27.27 
 
 		 438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2261  molecular chaperone-like  32.77 
 
 		 424 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00444779  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2935  HSP70 family molecular chaperone  31.05 
 
 		 443 aa  132  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1568  molecular chaperone-like protein  32.12 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  26.11 
 
 		 440 aa  129  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0648  putative heat shock protein  29.01 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  25.22 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3623  molecular chaperone-like protein  26.83 
 
 		 444 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0790615  normal  0.786192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0771  molecular chaperone-like protein  31.13 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1086  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  25.83 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  26.42 
 
 		 450 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  25.93 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0937  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  25.47 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.8548 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  26.64 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0515  putative heat shock protein 70 family protein  26.64 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.733871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2182  hypothetical protein  27.4 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107974  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  25.54 
 
 		 455 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  26.15 
 
 		 449 aa  117  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1199  putative chaperone protein DnaK  28.67 
 
 		 440 aa  117  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.574359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  25.44 
 
 		 450 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  33.94 
 
 		 430 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  27.58 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  28.76 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  28.76 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  27.65 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  28.76 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  25.22 
 
 		 450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  25.22 
 
 		 450 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  25.22 
 
 		 450 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  26.43 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>