More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0674 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0674  HSP70 family molecular chaperone  100 
 
 
434 aa  867    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2935  HSP70 family molecular chaperone  66.04 
 
 
443 aa  571  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4817  HSP70 family molecular chaperone  49.66 
 
 
438 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0648  putative heat shock protein  47.02 
 
 
429 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  45.48 
 
 
440 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  44.99 
 
 
438 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2578  HSP70 family molecular chaperone  49.31 
 
 
439 aa  360  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0611489  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2182  hypothetical protein  46.15 
 
 
447 aa  358  8e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107974  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0937  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  45.35 
 
 
430 aa  356  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.8548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1086  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  45.35 
 
 
430 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  44.84 
 
 
424 aa  347  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1385  molecular chaperone Hsp70 family  43.17 
 
 
430 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23815  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1199  putative chaperone protein DnaK  45.73 
 
 
440 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.574359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  43.13 
 
 
430 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0771  molecular chaperone-like protein  44.47 
 
 
433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  43.29 
 
 
428 aa  312  7.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  38.95 
 
 
440 aa  287  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  34.93 
 
 
425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  34.93 
 
 
423 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  35.58 
 
 
423 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  35.73 
 
 
425 aa  239  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  35.73 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3623  molecular chaperone-like protein  31.49 
 
 
444 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0790615  normal  0.786192 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  31.26 
 
 
421 aa  199  6e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0153  molecular chaperone-like protein  31.42 
 
 
448 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1690  molecular chaperone-like protein  33.65 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2261  molecular chaperone-like  34.27 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00444779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1615  molecular chaperone-like protein  33.26 
 
 
424 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  31.35 
 
 
423 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  30.96 
 
 
421 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  31.12 
 
 
423 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  30.89 
 
 
423 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  34.65 
 
 
415 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  32.47 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  32.78 
 
 
421 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  31.85 
 
 
420 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  33.26 
 
 
437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  35.45 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  30.63 
 
 
417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  30.04 
 
 
424 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  31.85 
 
 
419 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  30.68 
 
 
415 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  31.38 
 
 
421 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  31.34 
 
 
425 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  30.93 
 
 
421 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  32.14 
 
 
416 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1568  molecular chaperone-like protein  31.47 
 
 
428 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  30.19 
 
 
421 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  31.6 
 
 
417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  28.77 
 
 
419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  30.57 
 
 
428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  30.16 
 
 
425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  30.19 
 
 
418 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  29.79 
 
 
421 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  30.12 
 
 
420 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  31.6 
 
 
417 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  31.13 
 
 
417 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  33.49 
 
 
496 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  32.95 
 
 
416 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  30.63 
 
 
417 aa  150  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  29.44 
 
 
419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  32.81 
 
 
435 aa  146  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  32.74 
 
 
416 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  30.57 
 
 
438 aa  143  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  33.26 
 
 
416 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  31.32 
 
 
420 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  33.03 
 
 
416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  31.67 
 
 
422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  32.36 
 
 
420 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  30.68 
 
 
415 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  32.36 
 
 
420 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  33.18 
 
 
471 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  32.36 
 
 
420 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  32.36 
 
 
420 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  32.36 
 
 
420 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  32.36 
 
 
420 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  28.87 
 
 
421 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  32.21 
 
 
577 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  30.7 
 
 
443 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  31.53 
 
 
412 aa  136  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  29.77 
 
 
432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  31.04 
 
 
414 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  31.04 
 
 
414 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  28.3 
 
 
452 aa  131  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  31.87 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  30.54 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  31.41 
 
 
484 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  28.67 
 
 
450 aa  126  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  31.41 
 
 
484 aa  126  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  31.73 
 
 
484 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  30.71 
 
 
456 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  32.27 
 
 
416 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  28.44 
 
 
450 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  28.44 
 
 
450 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  29.47 
 
 
416 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  30.66 
 
 
416 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  31.73 
 
 
484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  27.05 
 
 
450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  31.21 
 
 
488 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  27.97 
 
 
450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>