More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1020 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  100 
 
 		 420 aa  850    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  54.5 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  51.09 
 
 		 412 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  54.01 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  53.41 
 
 		 412 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  35 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  40.05 
 
 		 415 aa  250  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  39.81 
 
 		 415 aa  249  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  39.56 
 
 		 437 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  36.88 
 
 		 423 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  36.88 
 
 		 423 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  38.5 
 
 		 417 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  36.64 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  36.94 
 
 		 421 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  39.34 
 
 		 416 aa  239  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  36.88 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  38.5 
 
 		 415 aa  236  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  36.9 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  35.53 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  34.91 
 
 		 421 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  36.3 
 
 		 417 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  37.95 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  36.04 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  36.06 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  34.52 
 
 		 421 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  37.56 
 
 		 419 aa  229  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  36.06 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  33.57 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  40.26 
 
 		 415 aa  227  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  36.28 
 
 		 420 aa  226  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  34.71 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  35.31 
 
 		 421 aa  222  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  36.59 
 
 		 438 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  37.71 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  37.95 
 
 		 443 aa  216  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  34.13 
 
 		 419 aa  213  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  34.78 
 
 		 421 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  34.12 
 
 		 421 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  34.35 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  35.51 
 
 		 416 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  36.47 
 
 		 422 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  35.27 
 
 		 416 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  35.12 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  35.96 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  35.27 
 
 		 416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  35.49 
 
 		 416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  37.35 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  36.47 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  36.36 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  36 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  35.73 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  36.12 
 
 		 420 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  36.12 
 
 		 420 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  36.12 
 
 		 420 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  36.12 
 
 		 420 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  36.12 
 
 		 420 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  36.12 
 
 		 577 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  34.61 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  34.91 
 
 		 416 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  32.94 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  28.33 
 
 		 425 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  28.5 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  25.83 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2935  HSP70 family molecular chaperone  32.04 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  28.5 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  31 
 
 		 430 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  27.86 
 
 		 423 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  25.96 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0674  HSP70 family molecular chaperone  31.32 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370304 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1615  molecular chaperone-like protein  31.04 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4817  HSP70 family molecular chaperone  29.59 
 
 		 438 aa  137  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  25.76 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  29.75 
 
 		 457 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1690  molecular chaperone-like protein  30.81 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  31.39 
 
 		 490 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  31.9 
 
 		 490 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  31.29 
 
 		 489 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2261  molecular chaperone-like  30.57 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00444779  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  29.71 
 
 		 490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  28.68 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  27.1 
 
 		 440 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  26.65 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  30.15 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  29.92 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  26.48 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2578  HSP70 family molecular chaperone  29.33 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0611489  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  26.04 
 
 		 450 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  26.11 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  26.48 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  26.48 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  26.71 
 
 		 484 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  26.71 
 
 		 484 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  25.77 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  26.29 
 
 		 484 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  27.29 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  25.22 
 
 		 450 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  26.54 
 
 		 424 aa  124  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2656  putative chaperone  30.65 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  26.87 
 
 		 450 aa  123  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1199  putative chaperone protein DnaK  30.14 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.574359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>