More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1521 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  74.23 
 
 
425 aa  659    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  100 
 
 
423 aa  870    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  72.75 
 
 
423 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  74.47 
 
 
425 aa  661    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  72.81 
 
 
425 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  36.15 
 
 
421 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  35.75 
 
 
440 aa  270  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2261  molecular chaperone-like  35.49 
 
 
424 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00444779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1690  molecular chaperone-like protein  35.25 
 
 
424 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1615  molecular chaperone-like protein  35.25 
 
 
424 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1568  molecular chaperone-like protein  35.9 
 
 
428 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0674  HSP70 family molecular chaperone  34.93 
 
 
434 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370304 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  32.7 
 
 
440 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  33.49 
 
 
430 aa  230  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  32.14 
 
 
438 aa  229  7e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3623  molecular chaperone-like protein  29.33 
 
 
444 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0790615  normal  0.786192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  33.82 
 
 
423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  33.82 
 
 
423 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  33.82 
 
 
423 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2935  HSP70 family molecular chaperone  33.02 
 
 
443 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2182  hypothetical protein  33.64 
 
 
447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107974  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  31.89 
 
 
424 aa  223  7e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1199  putative chaperone protein DnaK  33.1 
 
 
440 aa  222  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.574359 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0648  putative heat shock protein  29.76 
 
 
429 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4817  HSP70 family molecular chaperone  31.53 
 
 
438 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0937  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  29.62 
 
 
430 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.8548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0153  molecular chaperone-like protein  31.4 
 
 
448 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128082  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1086  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  29.48 
 
 
430 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  32.2 
 
 
419 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  33.88 
 
 
428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  33.09 
 
 
421 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  32.2 
 
 
421 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0771  molecular chaperone-like protein  33.49 
 
 
433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  31.72 
 
 
421 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  32.13 
 
 
421 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1385  molecular chaperone Hsp70 family  28.67 
 
 
430 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  31.21 
 
 
420 aa  208  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  33.25 
 
 
425 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  31.72 
 
 
424 aa  206  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  32.69 
 
 
421 aa  206  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  31.88 
 
 
421 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  32.14 
 
 
425 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  31.34 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  30.4 
 
 
417 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  30.88 
 
 
417 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  30.64 
 
 
417 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  31.01 
 
 
417 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2578  HSP70 family molecular chaperone  32.63 
 
 
439 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0611489  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  28.81 
 
 
421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  32.46 
 
 
420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  31.88 
 
 
416 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  30.43 
 
 
417 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  30.59 
 
 
416 aa  194  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  30.14 
 
 
419 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  28.99 
 
 
418 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  30.29 
 
 
416 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  29.57 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  29.57 
 
 
496 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  28.88 
 
 
415 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  28.64 
 
 
437 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  29.09 
 
 
415 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  29.33 
 
 
416 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  30.05 
 
 
416 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  30.05 
 
 
416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  29.09 
 
 
420 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  29.09 
 
 
420 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  29.09 
 
 
420 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  29.09 
 
 
420 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  29.09 
 
 
420 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  29.09 
 
 
420 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  29.09 
 
 
577 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  29.33 
 
 
471 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  30.02 
 
 
416 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  29.47 
 
 
416 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  29.79 
 
 
418 aa  176  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  30.12 
 
 
422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  31.68 
 
 
443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  29.65 
 
 
438 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  31.21 
 
 
432 aa  172  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  30.29 
 
 
422 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  30.83 
 
 
415 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  29.09 
 
 
419 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  27.64 
 
 
415 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  26.73 
 
 
414 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  26.73 
 
 
414 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  27.05 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  27.62 
 
 
412 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  25.59 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  25.96 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  25.05 
 
 
450 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  25.05 
 
 
450 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  24.84 
 
 
450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  24.84 
 
 
450 aa  136  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  24.84 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  24.62 
 
 
450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  24.62 
 
 
450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  24.84 
 
 
450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.559883 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  24.62 
 
 
450 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  25.32 
 
 
450 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  24.46 
 
 
450 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.690731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>