More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0321 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  93.49 
 
 
415 aa  773    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  99.04 
 
 
437 aa  816    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  100 
 
 
415 aa  821    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  75.42 
 
 
415 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  61.89 
 
 
417 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  62.44 
 
 
418 aa  496  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  62.38 
 
 
415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  50.24 
 
 
419 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  50.6 
 
 
419 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  47.2 
 
 
423 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  48.06 
 
 
425 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  47.2 
 
 
423 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  45.5 
 
 
421 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  46.72 
 
 
423 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  48.18 
 
 
421 aa  356  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  47.45 
 
 
421 aa  355  6.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  47.2 
 
 
417 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  45.26 
 
 
421 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  46.23 
 
 
421 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  46.99 
 
 
420 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  46.72 
 
 
417 aa  352  7e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  45.26 
 
 
424 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  46.47 
 
 
417 aa  348  8e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  46.23 
 
 
417 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  46.84 
 
 
425 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  41.67 
 
 
419 aa  346  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  46.96 
 
 
421 aa  342  8e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  40.1 
 
 
428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  44.12 
 
 
416 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  46.72 
 
 
421 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  43.88 
 
 
416 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  43.88 
 
 
416 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  43.65 
 
 
416 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  46.68 
 
 
416 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  43.65 
 
 
435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  43.88 
 
 
496 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  44.06 
 
 
420 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  44.76 
 
 
422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  44.05 
 
 
420 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  44.05 
 
 
471 aa  308  9e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  43.81 
 
 
420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  43.81 
 
 
420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  43.81 
 
 
420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  44.1 
 
 
422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  43.81 
 
 
420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  43.81 
 
 
420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  45.9 
 
 
432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  43.81 
 
 
577 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  42.48 
 
 
416 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  42.48 
 
 
416 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  44.04 
 
 
443 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  43.09 
 
 
438 aa  290  4e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  44.66 
 
 
418 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  40.24 
 
 
416 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  39.81 
 
 
420 aa  249  9e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  40.87 
 
 
412 aa  243  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  41.81 
 
 
412 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  40.29 
 
 
414 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  39.66 
 
 
414 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  31.09 
 
 
454 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  32.28 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  29.36 
 
 
456 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  36.02 
 
 
428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  29.04 
 
 
452 aa  190  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  31.13 
 
 
461 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  28.78 
 
 
421 aa  187  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  29.89 
 
 
450 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  29.89 
 
 
450 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  29.36 
 
 
456 aa  187  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  29.89 
 
 
450 aa  186  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  29.22 
 
 
484 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  29.22 
 
 
484 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  30.02 
 
 
490 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  28.88 
 
 
423 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  29.82 
 
 
490 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  30.95 
 
 
438 aa  182  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  30.92 
 
 
424 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  30.34 
 
 
425 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  30.1 
 
 
425 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  29.27 
 
 
489 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  29.07 
 
 
490 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  29.87 
 
 
455 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  29.01 
 
 
484 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  30 
 
 
440 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  28.1 
 
 
450 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  28.97 
 
 
457 aa  179  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  29.08 
 
 
484 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  28.57 
 
 
456 aa  178  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  30.33 
 
 
450 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  30.51 
 
 
423 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  33.49 
 
 
430 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  32.41 
 
 
418 aa  172  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  27.97 
 
 
450 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  27.97 
 
 
450 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  27.97 
 
 
450 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  27.97 
 
 
450 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  32.49 
 
 
440 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  27.97 
 
 
450 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  27.75 
 
 
450 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  27.97 
 
 
450 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>