More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1079 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  100 
 
 
425 aa  872    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  75.18 
 
 
423 aa  673    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  72.81 
 
 
423 aa  657    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  69.88 
 
 
425 aa  628  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  69.18 
 
 
425 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  36.74 
 
 
421 aa  288  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  35.93 
 
 
440 aa  252  9.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2261  molecular chaperone-like  36.06 
 
 
424 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00444779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1568  molecular chaperone-like protein  37.11 
 
 
428 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0674  HSP70 family molecular chaperone  34.93 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370304 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1615  molecular chaperone-like protein  35.66 
 
 
424 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3623  molecular chaperone-like protein  32.66 
 
 
444 aa  243  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0790615  normal  0.786192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  34.83 
 
 
430 aa  243  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1690  molecular chaperone-like protein  35.58 
 
 
424 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2182  hypothetical protein  35.96 
 
 
447 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107974  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  34.18 
 
 
440 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0937  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  31.75 
 
 
430 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.8548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1086  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  31.6 
 
 
430 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  36.6 
 
 
428 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2935  HSP70 family molecular chaperone  32.1 
 
 
443 aa  227  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  33.49 
 
 
438 aa  226  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0648  putative heat shock protein  30.88 
 
 
429 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  33.02 
 
 
424 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4817  HSP70 family molecular chaperone  33.65 
 
 
438 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1385  molecular chaperone Hsp70 family  30.32 
 
 
430 aa  212  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23815  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  32.85 
 
 
421 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  32.31 
 
 
423 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  32.31 
 
 
423 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  32.05 
 
 
423 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0771  molecular chaperone-like protein  33.73 
 
 
433 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0153  molecular chaperone-like protein  31.63 
 
 
448 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  33.08 
 
 
421 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  32.28 
 
 
415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  31.96 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1199  putative chaperone protein DnaK  32.54 
 
 
440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.574359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  31.91 
 
 
420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  30.99 
 
 
421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  32.04 
 
 
437 aa  199  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  31.7 
 
 
424 aa  199  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  31.36 
 
 
421 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  33.08 
 
 
421 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  30.68 
 
 
419 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  31.64 
 
 
416 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  31.25 
 
 
416 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  31.49 
 
 
416 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  31.31 
 
 
415 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2578  HSP70 family molecular chaperone  33.88 
 
 
439 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0611489  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  31.64 
 
 
421 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  31.67 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  31.7 
 
 
416 aa  189  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  31.25 
 
 
416 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  30.31 
 
 
419 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  31.98 
 
 
420 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  32.38 
 
 
425 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  31.25 
 
 
416 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  30.53 
 
 
435 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  30.53 
 
 
496 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  32 
 
 
422 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  31.49 
 
 
422 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  30.14 
 
 
418 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  28.92 
 
 
428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  33.91 
 
 
418 aa  180  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  30.19 
 
 
417 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  30.53 
 
 
471 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  30.37 
 
 
417 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  29.9 
 
 
417 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  30.53 
 
 
420 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  30.36 
 
 
417 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  30.27 
 
 
416 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  29.47 
 
 
417 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  30.29 
 
 
420 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  30.29 
 
 
420 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  30.29 
 
 
420 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  30.29 
 
 
420 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  30.29 
 
 
420 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  30.29 
 
 
577 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  29.47 
 
 
416 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  30.33 
 
 
419 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  32.5 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  31.55 
 
 
415 aa  173  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  29.86 
 
 
438 aa  173  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  30.4 
 
 
432 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  31.01 
 
 
415 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  28.67 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  31.28 
 
 
412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  26.97 
 
 
414 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  28.33 
 
 
420 aa  157  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  26.14 
 
 
412 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  25.76 
 
 
450 aa  144  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  25.76 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  25.76 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  25.81 
 
 
452 aa  141  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  26.09 
 
 
454 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  25.43 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  25.32 
 
 
456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  23.8 
 
 
450 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1614  putative chaperone  23.41 
 
 
449 aa  123  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0017  chaperone protein DnaK  26.59 
 
 
607 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0836411  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  23.3 
 
 
450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  25.22 
 
 
450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.690731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>