More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0648 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1086  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  74.3 
 
 		 430 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0937  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  74.77 
 
 		 430 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.8548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0648  putative heat shock protein  100 
 
 		 429 aa  865    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1385  molecular chaperone Hsp70 family  68.37 
 
 		 430 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23815  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2182  hypothetical protein  49.42 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107974  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  46.7 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4817  HSP70 family molecular chaperone  46.94 
 
 		 438 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  46.34 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  46.34 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0674  HSP70 family molecular chaperone  47.02 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2578  HSP70 family molecular chaperone  48.84 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0611489  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2935  HSP70 family molecular chaperone  44.39 
 
 		 443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0771  molecular chaperone-like protein  46.23 
 
 		 433 aa  342  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1199  putative chaperone protein DnaK  41.81 
 
 		 440 aa  319  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.574359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  40.95 
 
 		 430 aa  298  9e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  40.38 
 
 		 428 aa  283  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  40.88 
 
 		 440 aa  280  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  31.68 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  30.88 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  32.7 
 
 		 423 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  30.97 
 
 		 425 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  29.76 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  30.86 
 
 		 421 aa  199  7e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1615  molecular chaperone-like protein  32.05 
 
 		 424 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2261  molecular chaperone-like  32.05 
 
 		 424 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00444779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1690  molecular chaperone-like protein  31.81 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3623  molecular chaperone-like protein  28.22 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0790615  normal  0.786192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  28.16 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  29.98 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  28.74 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1568  molecular chaperone-like protein  30.94 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  29.74 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  27.16 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  28.5 
 
 		 423 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  28.98 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  28.5 
 
 		 423 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  28.77 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  29.81 
 
 		 415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  28.54 
 
 		 419 aa  156  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  27.36 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  29.12 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  27.4 
 
 		 428 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  29.12 
 
 		 421 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  26.95 
 
 		 424 aa  150  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  28.81 
 
 		 418 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  26.89 
 
 		 421 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  26.89 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  27.06 
 
 		 417 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  28.57 
 
 		 415 aa  146  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  28.88 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  26.25 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  26.87 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  28.54 
 
 		 421 aa  143  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  28.69 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  28.64 
 
 		 455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  28.1 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0153  molecular chaperone-like protein  27.01 
 
 		 448 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128082  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  26.01 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  26.35 
 
 		 415 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  28.1 
 
 		 416 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  25.78 
 
 		 417 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  27.62 
 
 		 496 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  28.1 
 
 		 416 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  27.62 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  26.15 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  28.1 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  26.9 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  26.48 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  28.69 
 
 		 456 aa  133  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  28.77 
 
 		 416 aa  132  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  27.34 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  28.8 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  27.42 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  26.08 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  28.22 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  28.27 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  28.1 
 
 		 422 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  26.43 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  27.12 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  27.95 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  30.19 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  28.07 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  27.95 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  26.89 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  28.07 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  28.07 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232925 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  28.18 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  28.16 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  28.73 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  28.18 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  28.07 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  27.19 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  27.76 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  28.07 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  26.19 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  26.19 
 
 		 577 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  26.19 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  26.19 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  26.19 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  26.19 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>