More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4817 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2578  HSP70 family molecular chaperone  78.59 
 
 
439 aa  665    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0611489  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4817  HSP70 family molecular chaperone  100 
 
 
438 aa  864    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  51.86 
 
 
440 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  50.7 
 
 
438 aa  411  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  49.53 
 
 
424 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0674  HSP70 family molecular chaperone  49.66 
 
 
434 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2182  hypothetical protein  49.54 
 
 
447 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107974  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0648  putative heat shock protein  46.94 
 
 
429 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1385  molecular chaperone Hsp70 family  46.51 
 
 
430 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23815  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0937  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  46.62 
 
 
430 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.8548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1086  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  46.62 
 
 
430 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2935  HSP70 family molecular chaperone  46.99 
 
 
443 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0771  molecular chaperone-like protein  49.42 
 
 
433 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1199  putative chaperone protein DnaK  44.65 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.574359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  41.55 
 
 
430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  41.42 
 
 
440 aa  299  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  41.51 
 
 
428 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  32.71 
 
 
425 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  32.47 
 
 
425 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  33.65 
 
 
423 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  33.65 
 
 
425 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  31.53 
 
 
423 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  30.8 
 
 
421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3623  molecular chaperone-like protein  30.91 
 
 
444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0790615  normal  0.786192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  29.14 
 
 
419 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  31.7 
 
 
419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  31.54 
 
 
421 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  31.66 
 
 
423 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  31.47 
 
 
424 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  30.77 
 
 
421 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  30.5 
 
 
418 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  31.44 
 
 
423 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  27.97 
 
 
428 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  31.44 
 
 
423 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  31.34 
 
 
417 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  30.66 
 
 
421 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0153  molecular chaperone-like protein  28.13 
 
 
448 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  31.44 
 
 
425 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  30.93 
 
 
421 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1615  molecular chaperone-like protein  31.31 
 
 
424 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  31.41 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1690  molecular chaperone-like protein  31.02 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  31.87 
 
 
420 aa  153  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  31.64 
 
 
415 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  32.18 
 
 
419 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  29.67 
 
 
421 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2261  molecular chaperone-like  30.84 
 
 
424 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00444779  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  30.43 
 
 
415 aa  149  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1568  molecular chaperone-like protein  30.54 
 
 
428 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  30.07 
 
 
418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  30.52 
 
 
437 aa  147  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  29.6 
 
 
438 aa  147  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  30.39 
 
 
471 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  30.32 
 
 
421 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  30.19 
 
 
417 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  31.08 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  29.84 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  29.82 
 
 
496 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  29.82 
 
 
435 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  29.48 
 
 
417 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  29.4 
 
 
420 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  29.72 
 
 
425 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  30.44 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  29.81 
 
 
415 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  29.26 
 
 
577 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  30.12 
 
 
420 aa  137  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  29.59 
 
 
420 aa  137  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  32.35 
 
 
450 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  29.54 
 
 
450 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  31.02 
 
 
443 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  32.35 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  29.82 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  29.14 
 
 
420 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  29.63 
 
 
416 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  29.14 
 
 
420 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  29.14 
 
 
420 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  29.43 
 
 
422 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  29.14 
 
 
420 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  29.14 
 
 
420 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  32.08 
 
 
450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  32.08 
 
 
450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  29.63 
 
 
416 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  28.9 
 
 
450 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  28.9 
 
 
450 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  31.81 
 
 
450 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  28.9 
 
 
450 aa  132  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  29.29 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  28.97 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  27.35 
 
 
450 aa  126  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  27.48 
 
 
416 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  28.67 
 
 
412 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  27.79 
 
 
422 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  26.32 
 
 
452 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  27.33 
 
 
450 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  27.18 
 
 
450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  29.54 
 
 
450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  29.26 
 
 
456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  27.12 
 
 
450 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  26.91 
 
 
450 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  26.96 
 
 
450 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>