More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0027 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  88.54 
 
 
416 aa  739    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  100 
 
 
420 aa  839    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  100 
 
 
420 aa  839    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  100 
 
 
577 aa  840    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  87.11 
 
 
416 aa  730    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  88.78 
 
 
422 aa  722    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  96.43 
 
 
471 aa  809    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  77.09 
 
 
416 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  100 
 
 
420 aa  839    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  99.29 
 
 
420 aa  831    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  88.07 
 
 
416 aa  734    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  78.38 
 
 
422 aa  641    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  77.57 
 
 
416 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  87.11 
 
 
435 aa  729    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  88.31 
 
 
416 aa  735    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  87.11 
 
 
496 aa  726    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  100 
 
 
420 aa  839    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  100 
 
 
420 aa  839    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  67.3 
 
 
416 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  58.24 
 
 
438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  53.76 
 
 
432 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  49.15 
 
 
416 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  46.63 
 
 
421 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  48.89 
 
 
443 aa  340  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  46.55 
 
 
420 aa  339  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  43.51 
 
 
425 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  44.47 
 
 
420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  46.63 
 
 
421 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  43.27 
 
 
424 aa  336  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  43.27 
 
 
423 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  43.27 
 
 
423 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  42.55 
 
 
421 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  43.94 
 
 
417 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  43.27 
 
 
423 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  45.5 
 
 
425 aa  333  4e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  42.31 
 
 
421 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  43.03 
 
 
421 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  44.39 
 
 
417 aa  329  6e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  43.03 
 
 
417 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  43.54 
 
 
417 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  42.24 
 
 
419 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  43.51 
 
 
421 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  46.8 
 
 
418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  44.05 
 
 
437 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  37.56 
 
 
428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  43.81 
 
 
415 aa  307  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  43.81 
 
 
415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  40.57 
 
 
417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  43.51 
 
 
421 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  41.77 
 
 
419 aa  293  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  37.32 
 
 
419 aa  289  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  42.62 
 
 
415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  39.01 
 
 
418 aa  280  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  44.63 
 
 
415 aa  279  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  36.04 
 
 
412 aa  203  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  36.12 
 
 
420 aa  192  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  32.69 
 
 
423 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  35.99 
 
 
412 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  29.93 
 
 
425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  31.81 
 
 
452 aa  179  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  35.02 
 
 
414 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  29.09 
 
 
423 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  29.69 
 
 
425 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  34.78 
 
 
414 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  30.29 
 
 
425 aa  176  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  30.5 
 
 
456 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  26.78 
 
 
454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  30.07 
 
 
456 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  30.17 
 
 
450 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  29.19 
 
 
421 aa  171  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  31.4 
 
 
475 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  29.65 
 
 
450 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  31.02 
 
 
457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  30.04 
 
 
450 aa  163  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  30.04 
 
 
450 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  30.04 
 
 
450 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  30.04 
 
 
450 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  29.65 
 
 
450 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  29.65 
 
 
450 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  30.17 
 
 
450 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  29.61 
 
 
450 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  29.98 
 
 
450 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  31.9 
 
 
418 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  29.61 
 
 
450 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  26.94 
 
 
450 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  27.74 
 
 
455 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  28.48 
 
 
450 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  29.76 
 
 
450 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  30.17 
 
 
450 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  28.29 
 
 
450 aa  159  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  29.61 
 
 
450 aa  159  8e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  29.83 
 
 
450 aa  159  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  32.12 
 
 
428 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  29.96 
 
 
450 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  27.21 
 
 
450 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  30.81 
 
 
450 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  33.26 
 
 
430 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  28.11 
 
 
490 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  28.11 
 
 
490 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  28.36 
 
 
490 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>