More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0376 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  100 
 
 
438 aa  895    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  89.04 
 
 
440 aa  800    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  96.35 
 
 
424 aa  850    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2182  hypothetical protein  49.42 
 
 
447 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107974  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4817  HSP70 family molecular chaperone  50.7 
 
 
438 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0648  putative heat shock protein  46.34 
 
 
429 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1385  molecular chaperone Hsp70 family  44.94 
 
 
430 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23815  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0771  molecular chaperone-like protein  46.17 
 
 
433 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2578  HSP70 family molecular chaperone  47.69 
 
 
439 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0611489  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1086  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  45.07 
 
 
430 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0937  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  44.6 
 
 
430 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.8548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0674  HSP70 family molecular chaperone  44.99 
 
 
434 aa  360  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2935  HSP70 family molecular chaperone  41.76 
 
 
443 aa  338  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1199  putative chaperone protein DnaK  42.04 
 
 
440 aa  332  6e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.574359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  37.09 
 
 
430 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  38.86 
 
 
428 aa  279  8e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  35.5 
 
 
440 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  33.81 
 
 
425 aa  249  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  32.86 
 
 
425 aa  240  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  33.81 
 
 
423 aa  233  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  32.14 
 
 
423 aa  229  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  33.49 
 
 
425 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  31.19 
 
 
415 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3623  molecular chaperone-like protein  31.01 
 
 
444 aa  186  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0790615  normal  0.786192 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  29.45 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  30.56 
 
 
437 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  30.95 
 
 
415 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  29.83 
 
 
423 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  28.84 
 
 
419 aa  172  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  29.59 
 
 
423 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  30.48 
 
 
420 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  30.31 
 
 
421 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  29.59 
 
 
423 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  29.59 
 
 
424 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  28.5 
 
 
417 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  30.31 
 
 
419 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  28.2 
 
 
428 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  28.91 
 
 
421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  28.98 
 
 
421 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2261  molecular chaperone-like  29.29 
 
 
424 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00444779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0153  molecular chaperone-like protein  27.29 
 
 
448 aa  163  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1615  molecular chaperone-like protein  29.52 
 
 
424 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  29.79 
 
 
443 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  28.74 
 
 
425 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  28.4 
 
 
438 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  28.85 
 
 
421 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1690  molecular chaperone-like protein  29.05 
 
 
424 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  29.5 
 
 
421 aa  159  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  28.85 
 
 
425 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1568  molecular chaperone-like protein  29.64 
 
 
428 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  28.33 
 
 
418 aa  155  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  28.71 
 
 
415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  29.02 
 
 
417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  30.26 
 
 
415 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  27.82 
 
 
421 aa  152  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  28.85 
 
 
421 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  29.79 
 
 
496 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  28.78 
 
 
417 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  29.58 
 
 
416 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  27.75 
 
 
418 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  29.58 
 
 
416 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  29.31 
 
 
435 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  29.58 
 
 
416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  29.34 
 
 
416 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  28.19 
 
 
417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  28.77 
 
 
471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  27.74 
 
 
420 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  28.54 
 
 
420 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  28.74 
 
 
416 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  29.19 
 
 
417 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  27.31 
 
 
422 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  28.27 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  28.13 
 
 
416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  28.27 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  28.27 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  28.27 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  28.27 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  28.13 
 
 
577 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  27.93 
 
 
432 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  27.66 
 
 
416 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  28.4 
 
 
422 aa  136  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  25.65 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  25.86 
 
 
450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  27.57 
 
 
454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  25.65 
 
 
450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  26.94 
 
 
450 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  26.94 
 
 
450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  26.94 
 
 
450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  26.94 
 
 
450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  26.56 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  27.41 
 
 
484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  25.43 
 
 
450 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  26.68 
 
 
450 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  25.43 
 
 
450 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  25.43 
 
 
450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  25.43 
 
 
450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  27.16 
 
 
484 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  25.22 
 
 
450 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  25 
 
 
450 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  28.83 
 
 
456 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>