More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4906 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  99.29 
 
 		 423 aa  845    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  100 
 
 		 423 aa  850    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  84.56 
 
 		 421 aa  727    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  84.32 
 
 		 421 aa  723    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  85.31 
 
 		 424 aa  739    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  81.47 
 
 		 421 aa  680    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  74.82 
 
 		 421 aa  652    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  95.01 
 
 		 421 aa  806    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  80.29 
 
 		 421 aa  660    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  80.29 
 
 		 421 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  99.29 
 
 		 423 aa  844    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  58.89 
 
 		 425 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  58.41 
 
 		 425 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  57.11 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  58.61 
 
 		 420 aa  491  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  56.63 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  56.63 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  56.28 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  56.7 
 
 		 419 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  46.86 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  48.93 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  47.69 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  47.2 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  47.2 
 
 		 415 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  46.25 
 
 		 418 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  44.58 
 
 		 420 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  47.82 
 
 		 415 aa  346  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  45.17 
 
 		 415 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  42.82 
 
 		 577 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  43.27 
 
 		 420 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  43.27 
 
 		 420 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  43.27 
 
 		 420 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  43.27 
 
 		 420 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  43.27 
 
 		 420 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  43.03 
 
 		 420 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  43.06 
 
 		 496 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  44.88 
 
 		 416 aa  332  6e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  42.58 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  42.86 
 
 		 416 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  42.86 
 
 		 416 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  42.35 
 
 		 471 aa  328  9e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  42.62 
 
 		 416 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  42.62 
 
 		 416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  43.54 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  42.58 
 
 		 416 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  43.06 
 
 		 416 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  43.99 
 
 		 443 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  41.71 
 
 		 422 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  40.44 
 
 		 416 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  37.97 
 
 		 428 aa  312  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  40.97 
 
 		 438 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  39.47 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  44.09 
 
 		 418 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  38.59 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  36.88 
 
 		 420 aa  242  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  34.54 
 
 		 425 aa  229  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  35.27 
 
 		 425 aa  229  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  33.82 
 
 		 423 aa  226  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  36.04 
 
 		 452 aa  223  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  32.17 
 
 		 450 aa  221  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  32.17 
 
 		 450 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  32.17 
 
 		 450 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  37.71 
 
 		 414 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  35.37 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  37.23 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  34.38 
 
 		 423 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  32.31 
 
 		 425 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  35.92 
 
 		 430 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  34.47 
 
 		 440 aa  206  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  36.53 
 
 		 428 aa  206  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  31.56 
 
 		 450 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  35.77 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  29.78 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  30.65 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  28.48 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  29.46 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  29.46 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  29.98 
 
 		 456 aa  194  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  30.22 
 
 		 450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  27.96 
 
 		 484 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  29.46 
 
 		 450 aa  182  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  27.96 
 
 		 484 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  32.62 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  27.9 
 
 		 490 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  27.76 
 
 		 484 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  27.9 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  27.49 
 
 		 489 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  27.7 
 
 		 490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  31.68 
 
 		 461 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  29.05 
 
 		 450 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  29.05 
 
 		 450 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  29.05 
 
 		 450 aa  179  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  27.37 
 
 		 484 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  28.82 
 
 		 450 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  28.82 
 
 		 450 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  28.6 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  28.6 
 
 		 450 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2404  putative chaperone  30.95 
 
 		 468 aa  177  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000139082  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  29.95 
 
 		 424 aa  177  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  28.6 
 
 		 450 aa  176  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>