More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1787 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  69.4 
 
 		 490 aa  667    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  70.33 
 
 		 484 aa  680    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2656  putative chaperone  74.89 
 
 		 459 aa  692    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  69.61 
 
 		 490 aa  669    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  69.69 
 
 		 488 aa  661    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  69.4 
 
 		 489 aa  669    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  69.06 
 
 		 490 aa  665    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  100 
 
 		 461 aa  938    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  69.92 
 
 		 484 aa  677    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  69.71 
 
 		 484 aa  676    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  69.92 
 
 		 484 aa  675    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  69.78 
 
 		 455 aa  659    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  74.68 
 
 		 457 aa  700    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2404  putative chaperone  65.38 
 
 		 468 aa  628  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000139082  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  65.8 
 
 		 456 aa  625  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  56.49 
 
 		 450 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  49.67 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  48.91 
 
 		 450 aa  431  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  48.04 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  48.91 
 
 		 450 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  48.7 
 
 		 450 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  48.7 
 
 		 450 aa  430  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  48.48 
 
 		 450 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  48.48 
 
 		 450 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  48.91 
 
 		 450 aa  431  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  48.7 
 
 		 450 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  48.26 
 
 		 450 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  48.7 
 
 		 450 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  48.91 
 
 		 450 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  48.48 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  47.17 
 
 		 456 aa  425  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  48.04 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  48.04 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  48.04 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  48.04 
 
 		 450 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  46.74 
 
 		 456 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  47.39 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  44.32 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  46.3 
 
 		 450 aa  415  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1614  putative chaperone  47.83 
 
 		 449 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  45.22 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  45 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  45.38 
 
 		 450 aa  398  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  46.52 
 
 		 450 aa  395  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  40.33 
 
 		 475 aa  339  8e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  37.88 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00220  putative heat shock protein 70 family protein  32.54 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0515  putative heat shock protein 70 family protein  32.69 
 
 		 437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.733871 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2983  putative heat shock protein 70 family protein  34.69 
 
 		 501 aa  210  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  35.08 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  31.84 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  30.39 
 
 		 421 aa  192  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  30.98 
 
 		 437 aa  190  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  31.13 
 
 		 415 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  30.47 
 
 		 417 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  32.65 
 
 		 419 aa  186  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  33.25 
 
 		 417 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  30.13 
 
 		 425 aa  183  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  33.16 
 
 		 425 aa  183  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  31.68 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  32.28 
 
 		 428 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  31.68 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  31.68 
 
 		 423 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  30.26 
 
 		 417 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  31.13 
 
 		 417 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  31.15 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  28.39 
 
 		 419 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  31.41 
 
 		 421 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  29.61 
 
 		 417 aa  176  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  30.91 
 
 		 424 aa  176  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  30.89 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  31.81 
 
 		 416 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  30.17 
 
 		 416 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  32.28 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  31.22 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  32.13 
 
 		 421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  28.57 
 
 		 415 aa  166  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  29.39 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  27.56 
 
 		 496 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  27.56 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  31.61 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  27.35 
 
 		 416 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  27.56 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  27.56 
 
 		 416 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  27.35 
 
 		 416 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  27.35 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  30.43 
 
 		 471 aa  156  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  32.05 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  31.85 
 
 		 421 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  30.87 
 
 		 443 aa  154  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  27.02 
 
 		 419 aa  152  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  29.92 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  29.92 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  29.92 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  27.94 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  29.92 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  29.92 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  29.92 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  29.92 
 
 		 577 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  36.51 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>