More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2283 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  82.65 
 
 		 488 aa  824    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  91.32 
 
 		 484 aa  909    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  83.44 
 
 		 489 aa  832    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2656  putative chaperone  68.39 
 
 		 459 aa  647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  69.71 
 
 		 461 aa  676    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  84.05 
 
 		 490 aa  837    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  66.25 
 
 		 455 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  83.47 
 
 		 490 aa  833    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  69.36 
 
 		 457 aa  669    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  98.97 
 
 		 484 aa  982    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  100 
 
 		 484 aa  991    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2404  putative chaperone  67.08 
 
 		 468 aa  659    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000139082  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  84.05 
 
 		 490 aa  834    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  98.55 
 
 		 484 aa  981    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  63.9 
 
 		 456 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  54.13 
 
 		 450 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  49.69 
 
 		 454 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  48.55 
 
 		 450 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  48.55 
 
 		 450 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  48.34 
 
 		 450 aa  451  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  46.47 
 
 		 450 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  46.27 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  46.68 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  46.47 
 
 		 450 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  46.47 
 
 		 450 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  46.47 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  46.47 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  46.47 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  46.47 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  46.47 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  45.02 
 
 		 456 aa  425  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  44.61 
 
 		 456 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  46.68 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  45.45 
 
 		 450 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  45.45 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  42.08 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  45.45 
 
 		 450 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  45.25 
 
 		 450 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  44.54 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  44.74 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  44.61 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1614  putative chaperone  46.27 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  42.24 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  44.81 
 
 		 450 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  37.84 
 
 		 475 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  36.7 
 
 		 418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00220  putative heat shock protein 70 family protein  31.56 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2983  putative heat shock protein 70 family protein  31.68 
 
 		 501 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0515  putative heat shock protein 70 family protein  29.69 
 
 		 437 aa  206  9e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.733871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  30.64 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  30.31 
 
 		 421 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  29.5 
 
 		 417 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  30.25 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  28.28 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  29.63 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  30.63 
 
 		 419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  27.87 
 
 		 421 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  27.87 
 
 		 424 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  28.37 
 
 		 423 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  29.22 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  29.77 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  29.22 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  28.16 
 
 		 423 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  29.1 
 
 		 417 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  27.96 
 
 		 423 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  29.71 
 
 		 417 aa  183  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  29.86 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  28.05 
 
 		 421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  28.63 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  28.28 
 
 		 417 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  30.9 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  27.29 
 
 		 419 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  29.28 
 
 		 421 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  27.31 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  26.64 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  27.31 
 
 		 496 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  27.61 
 
 		 421 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  27.1 
 
 		 435 aa  170  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  26.49 
 
 		 416 aa  167  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  30 
 
 		 420 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  27.57 
 
 		 415 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  26.28 
 
 		 416 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  28.04 
 
 		 416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  26.28 
 
 		 416 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  27.4 
 
 		 421 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  26.28 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  26.37 
 
 		 419 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01756  heat shock protein  29.88 
 
 		 458 aa  160  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.322701  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2937  heat shock protein  28.69 
 
 		 453 aa  154  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  28.21 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  28.46 
 
 		 420 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  29.19 
 
 		 443 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  28.98 
 
 		 430 aa  151  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  31.17 
 
 		 438 aa  149  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  28.21 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  28.21 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  28.21 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  28.21 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  28.21 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  26.27 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>