More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2404 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  64.89 
 
 		 490 aa  638    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  65.98 
 
 		 488 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  66.46 
 
 		 484 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  64.48 
 
 		 490 aa  638    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  67.24 
 
 		 456 aa  652    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  64.68 
 
 		 490 aa  637    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  64.89 
 
 		 489 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  66.67 
 
 		 484 aa  655    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  67.08 
 
 		 484 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2404  putative chaperone  100 
 
 		 468 aa  969    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000139082  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  66.46 
 
 		 484 aa  652    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  65.67 
 
 		 457 aa  631  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  65.38 
 
 		 461 aa  628  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2656  putative chaperone  65.17 
 
 		 459 aa  614  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  63.38 
 
 		 455 aa  599  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  52.56 
 
 		 450 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  47.65 
 
 		 454 aa  455  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  45.2 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  45.3 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  45.2 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  44.99 
 
 		 450 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  44.54 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  44.23 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  43.59 
 
 		 450 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  43.59 
 
 		 450 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  43.38 
 
 		 450 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  43.59 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  43.59 
 
 		 450 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  43.38 
 
 		 450 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  43.38 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1614  putative chaperone  43.8 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  43.59 
 
 		 450 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  44.23 
 
 		 449 aa  392  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  42.64 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  43.38 
 
 		 450 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  42.95 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  43.83 
 
 		 450 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  42.95 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  42.74 
 
 		 450 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  40.65 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  42.52 
 
 		 450 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  43.4 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  43.67 
 
 		 450 aa  385  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  42.52 
 
 		 450 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  39.71 
 
 		 475 aa  342  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  35.68 
 
 		 418 aa  261  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0515  putative heat shock protein 70 family protein  31.26 
 
 		 437 aa  219  7.999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.733871 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00220  putative heat shock protein 70 family protein  35.22 
 
 		 500 aa  206  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2983  putative heat shock protein 70 family protein  32.52 
 
 		 501 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  30.02 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  32.99 
 
 		 424 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  31.28 
 
 		 421 aa  183  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  31.71 
 
 		 421 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  30.77 
 
 		 421 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  26.54 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  28.18 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  30.95 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  30.95 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  28.69 
 
 		 417 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  28.78 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  30.69 
 
 		 423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  30.23 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  27.23 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01756  heat shock protein  29.86 
 
 		 458 aa  172  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.322701  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  32.73 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  27.59 
 
 		 419 aa  171  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  30.23 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  28.45 
 
 		 421 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  30.49 
 
 		 420 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  27.12 
 
 		 417 aa  163  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  28.54 
 
 		 420 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  26.98 
 
 		 415 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  26.28 
 
 		 437 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  26.28 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  30.37 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  28.38 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  28.68 
 
 		 422 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  28.83 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1615  heat shock protein  32.37 
 
 		 503 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  25.81 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  28.83 
 
 		 496 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  28.17 
 
 		 416 aa  156  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  25.85 
 
 		 419 aa  156  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  28.39 
 
 		 416 aa  156  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  28.39 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  28.39 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  29.15 
 
 		 421 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  28.93 
 
 		 471 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  25.42 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2937  heat shock protein  30.71 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  28.57 
 
 		 421 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  27.93 
 
 		 420 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  24.42 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  28.83 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  28.13 
 
 		 420 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  28.13 
 
 		 420 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  28.13 
 
 		 420 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  28.13 
 
 		 420 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  27.14 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  28.13 
 
 		 420 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>