More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2983 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00220  putative heat shock protein 70 family protein  66.47 
 
 		 500 aa  694    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2983  putative heat shock protein 70 family protein  100 
 
 		 501 aa  1037    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0515  putative heat shock protein 70 family protein  36.83 
 
 		 437 aa  264  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.733871 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  31.65 
 
 		 475 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  31.59 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  31.59 
 
 		 450 aa  233  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  31.17 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  31.31 
 
 		 456 aa  230  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  34.25 
 
 		 454 aa  229  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  31.27 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  31.03 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  31.92 
 
 		 450 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  31.92 
 
 		 450 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  31.92 
 
 		 450 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  31.92 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  31.19 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  31.19 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  31.92 
 
 		 450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  31.92 
 
 		 450 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  30.99 
 
 		 450 aa  219  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  31.92 
 
 		 450 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  31.72 
 
 		 450 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  31.54 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  31.71 
 
 		 450 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  31.31 
 
 		 490 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  31.31 
 
 		 490 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  31.31 
 
 		 490 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  30.44 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  31.92 
 
 		 488 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  31.44 
 
 		 484 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  31.68 
 
 		 484 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  30.18 
 
 		 449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  28.72 
 
 		 450 aa  213  7e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  31.21 
 
 		 484 aa  213  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  35.67 
 
 		 450 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  34.54 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  33.6 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  34.26 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  34.26 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2656  putative chaperone  35.62 
 
 		 459 aa  211  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  29.53 
 
 		 450 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  34.69 
 
 		 461 aa  210  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  33.93 
 
 		 450 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  32.51 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  33.7 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  30.71 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2404  putative chaperone  32.52 
 
 		 468 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000139082  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  32.5 
 
 		 456 aa  195  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1614  putative chaperone  32.04 
 
 		 449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2937  heat shock protein  28.28 
 
 		 453 aa  177  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01756  heat shock protein  28.11 
 
 		 458 aa  170  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.322701  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  29.26 
 
 		 421 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  31.84 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  31.84 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  30.08 
 
 		 421 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  31.28 
 
 		 415 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  31.55 
 
 		 417 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  29.52 
 
 		 423 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  29.52 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  29.52 
 
 		 421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  29.52 
 
 		 423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1615  heat shock protein  28.2 
 
 		 503 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  30.38 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  28.92 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  28.99 
 
 		 424 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  29.46 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  31.76 
 
 		 421 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  29.19 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  28.65 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  27.91 
 
 		 421 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  28.65 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  29.58 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  31.18 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  29.45 
 
 		 421 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  27.66 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  28.53 
 
 		 421 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  32.5 
 
 		 415 aa  146  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  27.93 
 
 		 420 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  29.45 
 
 		 421 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  27.3 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  28.97 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  26.83 
 
 		 419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  29.1 
 
 		 432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  28.18 
 
 		 420 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  29.22 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  27.12 
 
 		 428 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  27.68 
 
 		 496 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  28.12 
 
 		 430 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  29.51 
 
 		 443 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  27.68 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  27.08 
 
 		 416 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  27.22 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  29.41 
 
 		 428 aa  123  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  28.03 
 
 		 422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  27.22 
 
 		 416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  29.33 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  27.22 
 
 		 416 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  27.22 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  27.49 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  28.07 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>