More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1532 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  100 
 
 
419 aa  865    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  57.07 
 
 
428 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  42.65 
 
 
415 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  41.91 
 
 
437 aa  348  8e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  41.67 
 
 
415 aa  346  5e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  42.48 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  41.89 
 
 
417 aa  339  5e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  42.27 
 
 
417 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  41.26 
 
 
417 aa  333  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  41.57 
 
 
419 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  41.63 
 
 
425 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  40.44 
 
 
417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  40.58 
 
 
425 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  41.65 
 
 
415 aa  322  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  41.25 
 
 
420 aa  322  8e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  38.8 
 
 
421 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  41.75 
 
 
415 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  38.55 
 
 
421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  38.31 
 
 
416 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  38.8 
 
 
424 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  38.55 
 
 
435 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  38.65 
 
 
416 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  40.49 
 
 
420 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  38.31 
 
 
496 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  39.47 
 
 
423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  39.47 
 
 
423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  39.29 
 
 
418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  38.41 
 
 
416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  38.16 
 
 
416 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  39.23 
 
 
423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  37.11 
 
 
419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  38.65 
 
 
422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  38.66 
 
 
421 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  39.33 
 
 
416 aa  299  6e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  38.5 
 
 
421 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  38.98 
 
 
443 aa  292  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  36.99 
 
 
420 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  37.32 
 
 
420 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  37.32 
 
 
420 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  37.32 
 
 
420 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  37.32 
 
 
420 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  37.32 
 
 
420 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  37.5 
 
 
577 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  37.44 
 
 
471 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  36.75 
 
 
421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  36.23 
 
 
416 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  37.05 
 
 
422 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  35.51 
 
 
416 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  38.88 
 
 
432 aa  277  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  39.8 
 
 
418 aa  276  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  36.56 
 
 
421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  36.96 
 
 
416 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  36.68 
 
 
438 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  36.32 
 
 
421 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  35.63 
 
 
412 aa  239  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  33.57 
 
 
420 aa  227  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  35.78 
 
 
414 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  35.02 
 
 
412 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  35.54 
 
 
414 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  29.95 
 
 
421 aa  190  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  32.4 
 
 
428 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  31.14 
 
 
440 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  27.89 
 
 
450 aa  187  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  27.79 
 
 
454 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  27.65 
 
 
450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  30.6 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  29.88 
 
 
425 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  30.33 
 
 
425 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  28.91 
 
 
424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  28.14 
 
 
457 aa  173  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  26.8 
 
 
450 aa  173  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  28.84 
 
 
438 aa  172  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  29.12 
 
 
423 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4817  HSP70 family molecular chaperone  29.14 
 
 
438 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1568  molecular chaperone-like protein  33.41 
 
 
428 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  28.42 
 
 
455 aa  170  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  26.14 
 
 
450 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  29.09 
 
 
423 aa  169  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  27.61 
 
 
450 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  27.61 
 
 
450 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  27.61 
 
 
450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  29.37 
 
 
430 aa  166  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1385  molecular chaperone Hsp70 family  27.55 
 
 
430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23815  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  27.9 
 
 
440 aa  163  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1690  molecular chaperone-like protein  32.95 
 
 
424 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2261  molecular chaperone-like  32.95 
 
 
424 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00444779  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  27.02 
 
 
450 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  26.77 
 
 
484 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  26.37 
 
 
484 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  26.37 
 
 
484 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  25.61 
 
 
456 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1615  molecular chaperone-like protein  32.02 
 
 
424 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  30.45 
 
 
418 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  26.09 
 
 
450 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0648  putative heat shock protein  27.16 
 
 
429 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  26.36 
 
 
450 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  26.36 
 
 
450 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  25.76 
 
 
456 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  26.36 
 
 
450 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  26.14 
 
 
450 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.232925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>