More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3200 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  100 
 
 		 414 aa  804    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  99.03 
 
 		 414 aa  797    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  77.59 
 
 		 412 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  68.77 
 
 		 412 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  54.01 
 
 		 420 aa  401  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  40.53 
 
 		 415 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  34.22 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  36.99 
 
 		 417 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  36.75 
 
 		 417 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  39.28 
 
 		 425 aa  230  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  36.97 
 
 		 425 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  39.9 
 
 		 415 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  39.9 
 
 		 437 aa  229  8e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  35.54 
 
 		 419 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  36.52 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  40.96 
 
 		 415 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  39.57 
 
 		 415 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  37.23 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  40 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  37.23 
 
 		 423 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  38.93 
 
 		 420 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  36.98 
 
 		 423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  36.87 
 
 		 420 aa  222  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  35.85 
 
 		 421 aa  222  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  36.5 
 
 		 421 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  36.43 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  36.96 
 
 		 417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  38.69 
 
 		 418 aa  219  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  37.53 
 
 		 432 aa  219  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  37.05 
 
 		 416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  34.96 
 
 		 421 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  35.82 
 
 		 424 aa  215  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  36.67 
 
 		 421 aa  213  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  37.25 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  37.23 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  36.49 
 
 		 438 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  36.71 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  35.92 
 
 		 416 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  36.17 
 
 		 416 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  35.92 
 
 		 435 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  36.17 
 
 		 496 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  35.92 
 
 		 416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  36.89 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  35.68 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  35.52 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  35.27 
 
 		 471 aa  193  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  35.52 
 
 		 419 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  36.45 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  35.77 
 
 		 416 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  35.02 
 
 		 420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  34.78 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  34.78 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  34.78 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  34.78 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  34.78 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  34.78 
 
 		 577 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  36.5 
 
 		 416 aa  186  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  34.95 
 
 		 421 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  35.18 
 
 		 421 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  28.67 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  34.44 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  27.38 
 
 		 425 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  28.07 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  28.64 
 
 		 423 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  26.73 
 
 		 423 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  24.46 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1615  molecular chaperone-like protein  33.57 
 
 		 424 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0674  HSP70 family molecular chaperone  31.67 
 
 		 434 aa  143  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370304 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1690  molecular chaperone-like protein  33.57 
 
 		 424 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2935  HSP70 family molecular chaperone  32.24 
 
 		 443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2261  molecular chaperone-like  33.57 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00444779  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1199  putative chaperone protein DnaK  30.44 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.574359 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3623  molecular chaperone-like protein  26.79 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0790615  normal  0.786192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0648  putative heat shock protein  28.64 
 
 		 429 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1568  molecular chaperone-like protein  32.78 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  25.97 
 
 		 450 aa  126  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0771  molecular chaperone-like protein  30.48 
 
 		 433 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  25.17 
 
 		 450 aa  126  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  25.72 
 
 		 424 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  27.81 
 
 		 455 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  25.23 
 
 		 438 aa  124  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  24.7 
 
 		 440 aa  123  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  30.65 
 
 		 430 aa  123  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0515  putative heat shock protein 70 family protein  26.05 
 
 		 437 aa  123  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.733871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1086  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  25.9 
 
 		 430 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  28.97 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  27.03 
 
 		 450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  28.01 
 
 		 450 aa  120  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  24.73 
 
 		 456 aa  120  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  25.31 
 
 		 475 aa  119  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0937  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  25.64 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.8548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  27.4 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  26.43 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  27.05 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  27.3 
 
 		 490 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  27.3 
 
 		 490 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00220  putative heat shock protein 70 family protein  30.08 
 
 		 500 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  27.3 
 
 		 490 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  24.95 
 
 		 456 aa  113  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  25.38 
 
 		 456 aa  113  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>