More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3939 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  99.03 
 
 
414 aa  797    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  100 
 
 
414 aa  803    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  77.83 
 
 
412 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  68.77 
 
 
412 aa  531  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  54.5 
 
 
420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  34.46 
 
 
428 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  41.11 
 
 
415 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  36.99 
 
 
417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  36.75 
 
 
417 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  37.44 
 
 
425 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  40.29 
 
 
437 aa  232  9e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  40.29 
 
 
415 aa  231  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  41.76 
 
 
415 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  35.78 
 
 
419 aa  229  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  39.28 
 
 
425 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  36.52 
 
 
417 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  40.24 
 
 
443 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  37.71 
 
 
423 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  37.71 
 
 
423 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  38.82 
 
 
420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  37.47 
 
 
423 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  39.81 
 
 
415 aa  226  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  36.98 
 
 
421 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  36.34 
 
 
421 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  36.43 
 
 
417 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  36.63 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  37.2 
 
 
417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  39.17 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  37.53 
 
 
432 aa  219  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  35.45 
 
 
421 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  36.19 
 
 
424 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  37.29 
 
 
416 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  37.16 
 
 
421 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  37.71 
 
 
421 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  37.5 
 
 
419 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  37.2 
 
 
418 aa  206  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  36.17 
 
 
416 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  36.41 
 
 
416 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  36.17 
 
 
435 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  36.49 
 
 
438 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  36.41 
 
 
496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  36.17 
 
 
416 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  35.92 
 
 
416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  37.14 
 
 
422 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  35.51 
 
 
471 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  35.27 
 
 
420 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  35.52 
 
 
416 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  36.45 
 
 
422 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  35.28 
 
 
419 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  35.77 
 
 
416 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  35.02 
 
 
420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  35.02 
 
 
420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  35.02 
 
 
420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  35.02 
 
 
420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  35.02 
 
 
420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  35.02 
 
 
577 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  37.14 
 
 
416 aa  188  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  35.44 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  35.68 
 
 
421 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  27.86 
 
 
425 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  34.68 
 
 
428 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  26.97 
 
 
425 aa  166  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  28.54 
 
 
425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  28.88 
 
 
423 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  26.73 
 
 
423 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  24.46 
 
 
421 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1615  molecular chaperone-like protein  35.11 
 
 
424 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1690  molecular chaperone-like protein  35.11 
 
 
424 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2261  molecular chaperone-like  34.87 
 
 
424 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00444779  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0674  HSP70 family molecular chaperone  31.67 
 
 
434 aa  143  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2935  HSP70 family molecular chaperone  32.24 
 
 
443 aa  142  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3623  molecular chaperone-like protein  27.46 
 
 
444 aa  136  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0790615  normal  0.786192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1199  putative chaperone protein DnaK  30.44 
 
 
440 aa  132  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.574359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1568  molecular chaperone-like protein  33.66 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  26.19 
 
 
450 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0771  molecular chaperone-like protein  30.71 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  25.96 
 
 
424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0648  putative heat shock protein  28.39 
 
 
429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  25.47 
 
 
438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  24.94 
 
 
450 aa  127  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  25.18 
 
 
440 aa  126  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  27.81 
 
 
455 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0515  putative heat shock protein 70 family protein  26.27 
 
 
437 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.733871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  31.11 
 
 
430 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1086  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  26.15 
 
 
430 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  29.17 
 
 
450 aa  124  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  27.25 
 
 
450 aa  123  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  27.85 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  25.52 
 
 
475 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  28.69 
 
 
457 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0937  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  25.9 
 
 
430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.8548 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  26.43 
 
 
452 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  27.3 
 
 
489 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  27.54 
 
 
490 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  27.54 
 
 
490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  27.54 
 
 
490 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  24.3 
 
 
456 aa  116  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  29.29 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  27.79 
 
 
454 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2656  putative chaperone  26.3 
 
 
459 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.19318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>