More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5595 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  80.29 
 
 
423 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  78.15 
 
 
421 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  77.43 
 
 
421 aa  671    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  79.1 
 
 
421 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  80.52 
 
 
423 aa  690    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  78.62 
 
 
424 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  80.29 
 
 
423 aa  684    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  81.71 
 
 
421 aa  669    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  75.77 
 
 
421 aa  645    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  99.05 
 
 
421 aa  838    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  100 
 
 
421 aa  848    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  57.89 
 
 
425 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  58.21 
 
 
419 aa  490  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  56.7 
 
 
420 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  56.59 
 
 
425 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  55.29 
 
 
417 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  54.83 
 
 
417 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  54.7 
 
 
417 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  54.94 
 
 
417 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  48.09 
 
 
419 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  46.72 
 
 
437 aa  362  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  46.72 
 
 
415 aa  358  7e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  46.23 
 
 
415 aa  351  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  45.89 
 
 
418 aa  350  3e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  44.93 
 
 
417 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  49.03 
 
 
415 aa  346  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  46.38 
 
 
415 aa  340  4e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  43.51 
 
 
420 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  43.51 
 
 
420 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  43.51 
 
 
420 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  43.51 
 
 
420 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  43.51 
 
 
420 aa  336  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  43.51 
 
 
577 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  43.51 
 
 
420 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  43.51 
 
 
471 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  41.87 
 
 
420 aa  323  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  42.37 
 
 
416 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  42.51 
 
 
435 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  42.75 
 
 
496 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  42.37 
 
 
416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  42.37 
 
 
416 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  43.91 
 
 
416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  42.13 
 
 
416 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  42.13 
 
 
422 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  43.27 
 
 
443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  42.13 
 
 
416 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  40.44 
 
 
416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  43.06 
 
 
422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  41.78 
 
 
438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  42.13 
 
 
416 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  36.23 
 
 
428 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  36.32 
 
 
419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  43.6 
 
 
418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  37.59 
 
 
432 aa  273  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1020  molecular chaperone, DnaK  34.35 
 
 
420 aa  230  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.31559  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  32.37 
 
 
423 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  34.3 
 
 
425 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  34.06 
 
 
425 aa  222  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  31.3 
 
 
450 aa  219  5e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  31.3 
 
 
450 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  31.3 
 
 
450 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  33.59 
 
 
425 aa  217  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  33.89 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  34.77 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  30.94 
 
 
452 aa  211  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  30.02 
 
 
421 aa  207  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  36.45 
 
 
428 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  30.36 
 
 
450 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  29.19 
 
 
454 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  32.49 
 
 
440 aa  199  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  34.43 
 
 
430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4252  hypothetical protein  35.25 
 
 
412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271244  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3939  molecular chaperone, DnaK  35.68 
 
 
414 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350575  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3200  molecular chaperone, DnaK  35.19 
 
 
414 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175793  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  29.58 
 
 
456 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  29.46 
 
 
450 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  31.45 
 
 
490 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  31.45 
 
 
490 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  29.46 
 
 
450 aa  187  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  31.2 
 
 
489 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  31.2 
 
 
490 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  30.75 
 
 
484 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  30.43 
 
 
418 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  28.57 
 
 
450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  28.92 
 
 
456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  30.4 
 
 
450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  30.4 
 
 
450 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  30.4 
 
 
450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  30.4 
 
 
450 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  27.4 
 
 
484 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  33.07 
 
 
455 aa  182  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  27.4 
 
 
484 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  27.61 
 
 
484 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  29.24 
 
 
450 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  31.51 
 
 
488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  29.02 
 
 
450 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  29.02 
 
 
450 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  28.79 
 
 
450 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  28.57 
 
 
450 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  33.78 
 
 
450 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>