More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0024 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0024  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  884    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.253347  normal  0.084355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3761  hypothetical protein  49.19 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.440966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  45.33 
 
 		 428 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1199  putative chaperone protein DnaK  40.83 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.574359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4817  HSP70 family molecular chaperone  41.42 
 
 		 438 aa  299  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0674  HSP70 family molecular chaperone  38.95 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2182  hypothetical protein  39.27 
 
 		 447 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107974  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2935  HSP70 family molecular chaperone  39.19 
 
 		 443 aa  282  8.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0648  putative heat shock protein  40.88 
 
 		 429 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1385  molecular chaperone Hsp70 family  37.79 
 
 		 430 aa  276  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23815  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0937  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  38 
 
 		 430 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.8548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1521  molecular chaperone-like protein  35.75 
 
 		 423 aa  270  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2578  HSP70 family molecular chaperone  42.56 
 
 		 439 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0611489  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_004310  BR0376  HSP70 family protein  35.5 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1086  molecular chaperone heat shock protein (HSP70)  37.82 
 
 		 430 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  37.53 
 
 		 425 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0771  molecular chaperone-like protein  42.4 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0492  HSP70 family protein  36.47 
 
 		 440 aa  263  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0391  HSP70 family protein  34.42 
 
 		 424 aa  257  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  36.45 
 
 		 425 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1079  molecular chaperone-like protein  35.93 
 
 		 425 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2145  molecular chaperone-like protein  36.13 
 
 		 423 aa  252  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  34.99 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2145  heat shock protein  28.44 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  34.99 
 
 		 423 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  34.47 
 
 		 423 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  32.49 
 
 		 421 aa  203  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  32.27 
 
 		 421 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  33.33 
 
 		 421 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  32.72 
 
 		 424 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  32.5 
 
 		 421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  33.79 
 
 		 421 aa  193  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3623  molecular chaperone-like protein  30.69 
 
 		 444 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0790615  normal  0.786192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  32.27 
 
 		 421 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0153  molecular chaperone-like protein  29.96 
 
 		 448 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  32.8 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  31.14 
 
 		 419 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  32.5 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5595  putative heat-shock protein  32.04 
 
 		 421 aa  183  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1568  molecular chaperone-like protein  33.78 
 
 		 428 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  31.66 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  31.05 
 
 		 419 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  28.87 
 
 		 428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  32.49 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  30.45 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  30.23 
 
 		 417 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  33.48 
 
 		 438 aa  169  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  30.47 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1615  molecular chaperone-like protein  31.89 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  31.72 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  32.03 
 
 		 437 aa  167  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  30.82 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  32.21 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  32.37 
 
 		 416 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  31.79 
 
 		 415 aa  162  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  29.84 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1690  molecular chaperone-like protein  31.9 
 
 		 424 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.237195  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  31.75 
 
 		 416 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2261  molecular chaperone-like  31.05 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00444779  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  31.38 
 
 		 416 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5553  molecular chaperone, HSP70 class  33.1 
 
 		 415 aa  156  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0927629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  30.86 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  29.77 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  31.67 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  31.52 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  31.67 
 
 		 416 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  31.15 
 
 		 496 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  30.65 
 
 		 418 aa  151  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2728  putative chaperone  30.49 
 
 		 422 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  28.6 
 
 		 417 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  29.91 
 
 		 415 aa  149  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2804  chaperone protein, putative  30.54 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.336726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3173  putative chaperone protein  30.54 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1739  putative chaperone protein  30.54 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3623  molecular chaperone, Hsp70 class  30.54 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0027  putative chaperone protein  30.54 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3610  molecular chaperone, Hsp70 class  30.54 
 
 		 577 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3599  heat shock protein YegD  30.32 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.638521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  27.35 
 
 		 457 aa  146  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  30.32 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0508  putative chaperone protein  30.91 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00905902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  27.22 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  30 
 
 		 422 aa  143  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  29.13 
 
 		 443 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  26.35 
 
 		 461 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  28.64 
 
 		 416 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  27.72 
 
 		 456 aa  132  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  28.46 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  26.02 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  26.02 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  25.81 
 
 		 450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  25.81 
 
 		 450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  26.02 
 
 		 450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  25.81 
 
 		 450 aa  130  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  26.02 
 
 		 450 aa  130  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  28.42 
 
 		 475 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  25.81 
 
 		 450 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232925 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  25.81 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  27.33 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  27.33 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>