More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1615 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1615  heat shock protein  100 
 
 		 503 aa  1023    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01756  heat shock protein  41.01 
 
 		 458 aa  330  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.322701  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2937  heat shock protein  47.07 
 
 		 453 aa  316  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0780  hypothetical protein  33.08 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1588  putative chaperone  33.52 
 
 		 450 aa  171  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3007  putative chaperone  33.24 
 
 		 450 aa  169  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.559883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01975  predicted chaperone  33.52 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0991  putative chaperone  33.52 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01964  hypothetical protein  33.52 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1163  putative chaperone  33.24 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2210  putative chaperone  33.24 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2362  putative chaperone  33.24 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1572  putative chaperone  33.24 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0283269  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2481  putative chaperone  32.13 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2787  putative chaperone  32.41 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2683  putative chaperone  32.52 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2983  putative heat shock protein 70 family protein  28.2 
 
 		 501 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2253  putative chaperone  34.22 
 
 		 450 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1645  putative chaperone  32.37 
 
 		 449 aa  163  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2309  putative chaperone  34.22 
 
 		 450 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0566859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2353  putative chaperone  34.22 
 
 		 450 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00220  putative heat shock protein 70 family protein  30.32 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2360  putative chaperone  34.22 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.690731 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3110  putative chaperone  32.41 
 
 		 450 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2523  putative chaperone  35.58 
 
 		 455 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1340  putative chaperone  32.41 
 
 		 450 aa  160  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.506478  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1223  putative chaperone  32.41 
 
 		 450 aa  160  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1974  putative chaperone  34.2 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000699043  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2404  putative chaperone  32.37 
 
 		 468 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000139082  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0515  putative heat shock protein 70 family protein  29.23 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.733871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4835  putative chaperone  29.25 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3548  putative chaperone  32.6 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2454  putative chaperone  31.71 
 
 		 490 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1822  putative chaperone  31.48 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0574814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1835  putative chaperone  30.79 
 
 		 490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1871  putative chaperone  30.32 
 
 		 490 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.924477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1134  chaperone protein  31.74 
 
 		 418 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234862  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1614  putative chaperone  32.41 
 
 		 449 aa  150  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1764  putative chaperone  30.19 
 
 		 450 aa  150  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1384  putative chaperone  30.83 
 
 		 454 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0297823  normal  0.744499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2010  putative chaperone  31.73 
 
 		 450 aa  147  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2283  putative chaperone  30.98 
 
 		 484 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1787  putative chaperone  32.34 
 
 		 461 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.572185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2206  putative chaperone  31.44 
 
 		 484 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2416  putative chaperone  30.75 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0628577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1734  putative chaperone  30.23 
 
 		 488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2189  putative chaperone  31.16 
 
 		 484 aa  140  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2099  putative chaperone  31.54 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.918297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2656  putative chaperone  32.82 
 
 		 459 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.19318 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1036  putative heat-shock protein HSP 70  30.73 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05559  putative chaperone  29.69 
 
 		 450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06860  heat shock protein Hsp70 family  31.41 
 
 		 421 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001588  putative heat shock protein YegD  27.89 
 
 		 450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0999  putative chaperone  28.69 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2651  putative heat shock protein  29.63 
 
 		 420 aa  117  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0740827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0260  molecular chaperone, Hsp70 class  30.05 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1409  molecular chaperone, HSP70 class  31.47 
 
 		 420 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1795  putative heat shock protein  26.99 
 
 		 425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4849  dnaK protein, putative  28.69 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.136541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4727  molecular chaperone-like protein  28.69 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0576  heat shock protein YegD  28.69 
 
 		 424 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4906  HSP70 family protein  28.69 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.767353  hitchhiker  0.00135458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2203  putative chaperone protein  28.68 
 
 		 438 aa  106  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4441  heat shock protein YegD  28.53 
 
 		 421 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4898  heat shock protein YegD  28.91 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0352  molecular chaperone, HSP70 class  29.79 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0277  molecular chaperone, HSP70 class  27.84 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0321  molecular chaperone, HSP70 class  28.53 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0901748  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1060  molecular chaperone, HSP70 class  31.82 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0628  molecular chaperone, HSP70 class  29 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0682  molecular chaperone-like protein  30.38 
 
 		 421 aa  101  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.4345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2228  putative chaperone  28.04 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00786823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4956  heat shock protein  26.58 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.674531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4641  HSP70 family protein  29.21 
 
 		 421 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3447  putative heat shock protein  27.3 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1429  DnaK-type molecular chaperone DnaK  27.47 
 
 		 428 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.370415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1123  putative chaperone protein (yegD)  28.65 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3590  molecular chaperone-like  27.66 
 
 		 416 aa  97.4  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0639  heat shock protein  27.01 
 
 		 417 aa  97.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0407  molecular chaperone-like protein  28.76 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172519  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1836  molecular chaperone, HSP70 class  29.14 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127585  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3100  heat shock protein  26.91 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0433  molecular chaperone-like protein  28.38 
 
 		 496 aa  94  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172906  normal  0.275665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1532  molecular chaperone, HSP70 class  26.88 
 
 		 419 aa  93.6  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.868422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0475  molecular chaperone-like protein  27.2 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0429  putative chaperone  26.68 
 
 		 416 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0363549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64450  putative heat-shock protein  29.33 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1948  molecular chaperone, Hsp70 class  30.74 
 
 		 418 aa  91.3  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0757113  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5657  putative chaperone protein  27.3 
 
 		 417 aa  91.3  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0963409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1590  molecular chaperone, HSP70 class  27.27 
 
 		 415 aa  90.5  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3529  putative chaperone  26.15 
 
 		 416 aa  90.1  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168986  normal  0.311159 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4255  molecular chaperone, DnaK  28.72 
 
 		 412 aa  89.7  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0502  molecular chaperone-like protein  26.93 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2603  molecular chaperone-like  26.67 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6322  hypothetical protein  27.72 
 
 		 428 aa  87.8  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2895  molecular chaperone-like protein  26.93 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1622  molecular chaperone-like protein  28.06 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2603  molecular chaperone-like protein  27.82 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2937  chaperone protein, putative  28.27 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3623  molecular chaperone-like protein  28.74 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0790615  normal  0.786192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>