More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0451 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0451  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 308 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739905  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5078  malonate utilization transcriptional regulator  96.75 
 
 		 308 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5293  LysR family transcriptional regulator  86.09 
 
 		 305 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143312  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02650  putative malonate utilization transcriptional regulator  83.83 
 
 		 309 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0883739  normal  0.518056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0301  malonate utilization transcriptional regulator  82.14 
 
 		 309 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.477196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10390  malonate utilisation transciptional regulator, LysR family  82.45 
 
 		 305 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2874  LysR family transcriptional regulator  80.67 
 
 		 303 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0140369  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2743  LysR family transcriptional regulator  80.33 
 
 		 303 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5377  transcriptional regulator, LysR family  51.85 
 
 		 304 aa  322  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6326  transcriptional regulator, LysR family  50.84 
 
 		 304 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1770  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 304 aa  319  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0955  LysR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 304 aa  316  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2897  LysR family transcriptional regulator  51.34 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3862  transcriptional regulator, LysR family  49.01 
 
 		 301 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.484372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4938  transcriptional regulator, LysR family  49.01 
 
 		 301 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.182259 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4924  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 306 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1014  LysR family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 347 aa  298  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131098  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3934  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 305 aa  298  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3771  LysR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 312 aa  292  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368263  normal  0.0120548 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1239  transcriptional regulator, LysR family  46.86 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2604  transcriptional regulator, LysR family  47.37 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3660  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  43.52 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0626  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 302 aa  261  8e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000742904  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1230  transcriptional regulator, LysR family  40.62 
 
 		 222 aa  172  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  26.14 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  26.03 
 
 		 300 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4029  transcriptional regulator, LysR family  33.05 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185534  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  25.44 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3802  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.238076  normal  0.337014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06400  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.450023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3273  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  25.86 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5722  transcriptional regulator, LysR family  23.67 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437697  normal  0.903757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  26.56 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7065  transcriptional regulator, LysR family  23.67 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000862794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 297 aa  89.4  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2003  LysR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4555  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.35 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1113  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7050  transcriptional regulator, LysR family  23.27 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5919  transcriptional regulator, LysR family  23.27 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5567  tartrate utilization transcriptional regulator  27 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  26.91 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4972  transcriptional regulator, LysR family  23.27 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3623  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6244  transcriptional regulator, LysR family  23.27 
 
 		 296 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235646  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4970  transcriptional regulator, LysR family  22.86 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  22.94 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  23.38 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1340  putative transcriptional regulator  28.62 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1381  transcriptional regulator, LysR family  25.96 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0155943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6562  transcriptional regulator, LysR family  22.86 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0020  LysR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2030  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  22.58 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  26.51 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  22.26 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  24.5 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4101  transcriptional regulator LysR family  26.1 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0491587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  23.02 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7661  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  24.5 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  24.5 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  24.5 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5165  LysR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  27.52 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  27.51 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>