More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0611 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  64.65 
 
 		 489 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0351  ribonuclease  65.66 
 
 		 488 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1891  ribonuclease G  65.66 
 
 		 488 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  63.8 
 
 		 483 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2529  RNAse G  66.26 
 
 		 486 aa  643    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1377  ribonuclease G  65.86 
 
 		 488 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.231093  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0977  ribonuclease  65.79 
 
 		 490 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5628  ribonuclease G  65.66 
 
 		 489 aa  639    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0799  ribonuclease G  65.66 
 
 		 488 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  65.25 
 
 		 489 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0611  ribonuclease  100 
 
 		 487 aa  996    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0778  RNAse G  66.4 
 
 		 510 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1689  ribonuclease  65.66 
 
 		 489 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.741186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1233  ribonuclease  65.86 
 
 		 488 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1224  ribonuclease  65.86 
 
 		 488 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2218  ribonuclease  65.45 
 
 		 489 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.513685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2339  ribonuclease  65.45 
 
 		 489 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0414308  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2324  ribonuclease  65.66 
 
 		 489 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.161969  normal  0.359737 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2301  ribonuclease  65.66 
 
 		 489 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  65.25 
 
 		 489 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1068  ribonuclease G  65.66 
 
 		 488 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.112502  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  61.55 
 
 		 495 aa  633  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2395  ribonuclease, Rne/Rng family  64.85 
 
 		 489 aa  631  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1008  ribonuclease G  65.79 
 
 		 508 aa  634  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  61.55 
 
 		 495 aa  632  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1995  ribonuclease, Rne/Rng family  64.65 
 
 		 489 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422302  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2197  ribonuclease G  64.24 
 
 		 489 aa  627  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3824  ribonuclease, Rne/Rng family  64.69 
 
 		 484 aa  624  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  61.61 
 
 		 499 aa  626  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  60.59 
 
 		 501 aa  621  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  60.96 
 
 		 517 aa  618  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  61.12 
 
 		 491 aa  617  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  61.35 
 
 		 515 aa  613  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2622  ribonuclease  61.16 
 
 		 495 aa  612  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134326  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  60.12 
 
 		 508 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  62.04 
 
 		 483 aa  593  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0364  ribonuclease  60.49 
 
 		 483 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1946  ribonuclease  58.84 
 
 		 493 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1344  ribonuclease G  59.6 
 
 		 490 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2112  ribonuclease G  59.92 
 
 		 483 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  53.21 
 
 		 492 aa  542  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  54.33 
 
 		 490 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  54.97 
 
 		 487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  53.19 
 
 		 496 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  50.6 
 
 		 496 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  50.8 
 
 		 492 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  50.6 
 
 		 496 aa  514  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  52.45 
 
 		 484 aa  508  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  52.61 
 
 		 493 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  53.56 
 
 		 492 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  53.97 
 
 		 485 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  53.36 
 
 		 485 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  53.56 
 
 		 485 aa  508  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  53.77 
 
 		 485 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  53.56 
 
 		 485 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  53.16 
 
 		 485 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  53.36 
 
 		 485 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  53.36 
 
 		 485 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  49.7 
 
 		 490 aa  498  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  50.1 
 
 		 488 aa  495  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  49.9 
 
 		 485 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  53.16 
 
 		 485 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  52.95 
 
 		 485 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2137  ribonuclease  53.59 
 
 		 482 aa  497  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  49.5 
 
 		 487 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0379  ribonuclease G  52.24 
 
 		 484 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  51.11 
 
 		 489 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  51.11 
 
 		 489 aa  485  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  51.11 
 
 		 489 aa  485  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1989  ribonuclease, Rne/Rng family  49.8 
 
 		 504 aa  485  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  50.89 
 
 		 497 aa  485  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  51.11 
 
 		 489 aa  485  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  51.11 
 
 		 489 aa  485  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  51.11 
 
 		 489 aa  485  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  51.11 
 
 		 489 aa  485  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  51.11 
 
 		 489 aa  485  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  51.89 
 
 		 493 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  47.85 
 
 		 528 aa  484  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  50.89 
 
 		 497 aa  484  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  47.66 
 
 		 528 aa  484  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  50.7 
 
 		 489 aa  482  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  50.1 
 
 		 489 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  50.1 
 
 		 489 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  50.1 
 
 		 489 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  50.1 
 
 		 489 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  49.5 
 
 		 489 aa  481  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  50.1 
 
 		 489 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  50.1 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  49.7 
 
 		 489 aa  478  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  49.5 
 
 		 489 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  49.5 
 
 		 489 aa  474  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  49.5 
 
 		 489 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  50.7 
 
 		 495 aa  472  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  49.5 
 
 		 489 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  50.99 
 
 		 499 aa  472  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  49.5 
 
 		 489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0562  ribonuclease G  49.09 
 
 		 500 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.229601  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  49.09 
 
 		 489 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  50.3 
 
 		 502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  49.3 
 
 		 489 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>