119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1764 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1764  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  319  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.117494 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6842  dehydratase  59.06 
 
 
158 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3559  hypothetical protein  48 
 
 
155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2996  hypothetical protein  45.95 
 
 
165 aa  136  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0903588  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4072  hypothetical protein  46.31 
 
 
153 aa  136  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00371629  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0206  hypothetical protein  44 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.603471  normal  0.590888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0059  hypothetical protein  47.3 
 
 
155 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1037  dehydratase  45.03 
 
 
163 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3292  MaoC-like dehydratase  43.66 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5257  hypothetical protein  36.69 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  37.78 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  40.16 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  37.68 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2898  MaoC domain protein dehydratase  26.76 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1030  MaoC domain protein dehydratase  28.79 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329133  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  35.61 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  31.41 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  35.29 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  40.15 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2124  MaoC domain protein dehydratase  32.84 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000215155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1834  MaoC-like dehydratase  25.38 
 
 
171 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.420495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  31.58 
 
 
149 aa  60.5  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1191  MaoC-like dehydratase  28.47 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  30.88 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4357  MaoC domain protein dehydratase  31.34 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0411099  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  33.33 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  26.76 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  29.93 
 
 
690 aa  53.9  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.69 
 
 
664 aa  53.9  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  29.45 
 
 
679 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  27.66 
 
 
686 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.57 
 
 
678 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4109  dehydratase  30.77 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294085  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  31.29 
 
 
686 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  31.34 
 
 
157 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.22 
 
 
676 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2549  dehydratase  27.48 
 
 
154 aa  50.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0407782  normal  0.257026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  33.81 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2275  dehydratase  24.81 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3102  MaoC domain protein dehydratase  27.46 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477057 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1603  MaoC domain protein dehydratase  33.12 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.535625  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7163  MaoC-like dehydratase  30.3 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4127  dehydratase  31.3 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  31.88 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3812  putative dehydratase  27.21 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  34.45 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  26.72 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  34.45 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  34.45 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  26 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  31.03 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  29.1 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  32.12 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7491  MaoC-like dehydratase  26.77 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  26 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  28.68 
 
 
515 aa  48.5  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4965  dehydratase  24.81 
 
 
183 aa  48.5  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6336  MaoC-like dehydratase  27.97 
 
 
172 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00693601  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  35.07 
 
 
150 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  34.09 
 
 
153 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  27.07 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  28.76 
 
 
684 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  26.92 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0480  MaoC domain-containing protein  30.17 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  28.68 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  28.29 
 
 
199 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  28.99 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0676  dehydratase  32.33 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251329  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  28.86 
 
 
683 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2555  dehydratase  33.61 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4972  dehydratase  27.82 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810088  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0013  dehydratase  26.52 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  30.28 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  28.57 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  26.72 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1709  dehydrogenase with MaoC-like domain  30.17 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  27.92 
 
 
690 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  29.41 
 
 
169 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  29.05 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  32.37 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4088  dehydratase  34.45 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0156653  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2249  dehydratase  25.49 
 
 
171 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  0.226342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  29.8 
 
 
682 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0972  dehydratase  27.48 
 
 
184 aa  44.3  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5510  MaoC domain protein dehydratase  25.35 
 
 
152 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.427484 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  34.59 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3103  MaoC domain protein dehydratase  26.61 
 
 
179 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000549225 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  29.71 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1584  dehydratase  30.94 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0906655  hitchhiker  0.00294488 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  28.67 
 
 
678 aa  43.9  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1312  hypothetical protein  30.83 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  30.22 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2716  MaoC-like dehydratase  25.85 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695357  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0487  MaoC-like dehydratase  26.92 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.448787  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0731  dehydratase  30.83 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2157  MaoC domain-containing protein  24.82 
 
 
175 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2117  MaoC domain-containing protein  24.82 
 
 
175 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.456393 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2267  dehydratase  24.82 
 
 
216 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8223  MaoC domain protein dehydratase  27.94 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.924905  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3698  MaoC-related protein  42.03 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27276  normal  0.530433 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>