130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2996 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2996  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  335  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0903588  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0059  hypothetical protein  77.03 
 
 
155 aa  231  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3559  hypothetical protein  74.5 
 
 
155 aa  229  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4072  hypothetical protein  68.29 
 
 
153 aa  220  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00371629  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0206  hypothetical protein  62.76 
 
 
156 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.603471  normal  0.590888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1037  dehydratase  50.32 
 
 
163 aa  169  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1764  hypothetical protein  45.95 
 
 
155 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.117494 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6842  dehydratase  41.18 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3292  MaoC-like dehydratase  34.72 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2124  MaoC domain protein dehydratase  34.48 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000215155  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  31.72 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  31.97 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  33.6 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  30.77 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  31.16 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  36.11 
 
 
686 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  31.72 
 
 
152 aa  61.6  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  32.58 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  31.03 
 
 
152 aa  57.4  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3284  dehydratase  34.62 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2898  MaoC domain protein dehydratase  29.6 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  27.7 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  31.29 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  31.75 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1030  MaoC domain protein dehydratase  30.43 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  30.82 
 
 
149 aa  55.1  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8223  MaoC domain protein dehydratase  26.14 
 
 
150 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.924905  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5257  hypothetical protein  30.22 
 
 
161 aa  53.9  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  29.63 
 
 
150 aa  53.9  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  26.95 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  31.54 
 
 
679 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  28.89 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1039  dehydratase  27.46 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  31.21 
 
 
150 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  33.64 
 
 
140 aa  52  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7491  MaoC-like dehydratase  34.68 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0832  putative dehydratase  30.97 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0146859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  30.23 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1834  MaoC-like dehydratase  31.75 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.420495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  24.81 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  31.54 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2797  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  31.78 
 
 
469 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022761 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  34.43 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1425  maoC family protein  23.7 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1205  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  23.7 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  30 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  25.95 
 
 
139 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5194  dehydratase  29.17 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  27.78 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1466  maoC family protein  23.7 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1226  maoC family protein  23.7 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1203  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  23.7 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1326  MaoC family protein  23.7 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1401  maoC family protein  23.7 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2811  dehydratase  31.48 
 
 
152 aa  48.5  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.894889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1364  maoC family protein  23.7 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.168458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3980  maoC family protein  23.7 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  30.67 
 
 
681 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 
681 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  33.88 
 
 
176 aa  48.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 
681 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  30.14 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3597  dehydratase  30.65 
 
 
158 aa  48.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  29.46 
 
 
150 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 
681 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  27.81 
 
 
166 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4212  MaoC domain protein dehydratase  30.63 
 
 
174 aa  47.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  27.81 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  26.47 
 
 
147 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1227  dehydratase  22.96 
 
 
179 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  27.97 
 
 
150 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5970  MaoC domain protein dehydratase  29.2 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0874793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  29.25 
 
 
690 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  32.23 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  32.23 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00460  acyl dehydratase  32.37 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1970  dehydratase  26.62 
 
 
353 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0961823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.07 
 
 
682 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3371  MaoC domain-containing protein  27.82 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3698  MaoC-related protein  29.2 
 
 
155 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27276  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0566  dehydratase  25.19 
 
 
344 aa  45.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.090067 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1055  dehydratase  30.65 
 
 
144 aa  44.7  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  31.4 
 
 
147 aa  44.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  26.67 
 
 
148 aa  44.3  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  27.81 
 
 
199 aa  44.7  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  28.57 
 
 
144 aa  43.9  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0620  MaoC-like dehydratase  28.77 
 
 
157 aa  43.9  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  25.9 
 
 
150 aa  43.9  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  27.63 
 
 
148 aa  44.3  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3364  MaoC-like dehydratase  31.07 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.975509  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3812  putative dehydratase  25.17 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  28.68 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  28.57 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0611  dehydratase  29.79 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519544  normal  0.134756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4109  dehydratase  26.21 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294085  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2979  dehydratase  24.5 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495865  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  28 
 
 
690 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4505  MaoC-like dehydratase  23.24 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.547822 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  28.78 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  26.36 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>