149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3559 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3559  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4072  hypothetical protein  83.66 
 
 
153 aa  261  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00371629  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2996  hypothetical protein  74.5 
 
 
165 aa  229  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0903588  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0059  hypothetical protein  75.5 
 
 
155 aa  229  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0206  hypothetical protein  59.74 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.603471  normal  0.590888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1037  dehydratase  56.08 
 
 
163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1764  hypothetical protein  48 
 
 
155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.117494 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6842  dehydratase  42.48 
 
 
158 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3292  MaoC-like dehydratase  34.72 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  37.41 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  34.4 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  31.75 
 
 
157 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2124  MaoC domain protein dehydratase  30.34 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000215155  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  28.77 
 
 
166 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  31.91 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0013  dehydratase  29.22 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  32.59 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  34.51 
 
 
686 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  32.37 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  32.59 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  30 
 
 
164 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  29.08 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  31.3 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2811  dehydratase  32.88 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.894889 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  32.48 
 
 
679 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  30.61 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  30.88 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5257  hypothetical protein  30.22 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  32.35 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1030  MaoC domain protein dehydratase  30.65 
 
 
157 aa  54.3  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2683  dehydratase  29.05 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00460  acyl dehydratase  33.33 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  33.93 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1834  MaoC-like dehydratase  32 
 
 
171 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.420495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  30.92 
 
 
690 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  30.95 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3284  dehydratase  33.06 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3597  dehydratase  34.03 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  29.73 
 
 
150 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  30.67 
 
 
681 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
681 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 
681 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0972  dehydratase  29.25 
 
 
184 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 
681 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  36.45 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  32.35 
 
 
176 aa  51.2  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2898  MaoC domain protein dehydratase  27.34 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  32.59 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1390  dehydratase  33.06 
 
 
186 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.542578  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 
149 aa  50.8  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  28.97 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.81 
 
 
695 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  26.72 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4109  dehydratase  30.15 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294085  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1360  MaoC domain protein dehydratase  30.66 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0206053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1408  MaoC domain protein dehydratase  30.41 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.13 
 
 
682 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5194  dehydratase  29.92 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5970  MaoC domain protein dehydratase  31.67 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0874793  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6218  dehydratase  31.71 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3812  putative dehydratase  28.76 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  33.65 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7491  MaoC-like dehydratase  34.13 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  28.03 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  29.53 
 
 
684 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1594  dehydratase  28.99 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.691822  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  36.45 
 
 
147 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.88 
 
 
684 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3849  MaoC domain protein dehydratase  32.23 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  28.57 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.88 
 
 
684 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.41 
 
 
683 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  30.16 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3467  MaoC-like dehydratase  33.01 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.273532  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  35.51 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1289  MaoC-like dehydratase  36.84 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1055  dehydratase  31.51 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  35.51 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.16 
 
 
683 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  27.7 
 
 
690 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.88 
 
 
684 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3000  MaoC domain-containing protein  24.48 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0628235  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2693  dehydratase  24.48 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215735  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  23.93 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  31.09 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  26 
 
 
683 aa  44.7  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2275  dehydratase  22.96 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3318  MaoC domain protein dehydratase  30.3 
 
 
175 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 
686 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  29.41 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  27.46 
 
 
147 aa  44.3  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  28.81 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6530  dehydratase  25.35 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82464  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6245  dehydratase  25.35 
 
 
152 aa  43.9  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  30.23 
 
 
464 aa  43.9  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3753  MaoC domain protein dehydratase  27.56 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0985458  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1205  dehydratase; 3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  27.87 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  29.41 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1468  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.35 
 
 
478 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150978  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0611  dehydratase  31.19 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519544  normal  0.134756 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>