117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1037 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1037  dehydratase  100 
 
 		 163 aa  330  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3559  hypothetical protein  56.08 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4072  hypothetical protein  53.42 
 
 		 153 aa  170  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00371629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2996  hypothetical protein  50.32 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0903588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0059  hypothetical protein  54.11 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0206  hypothetical protein  48.3 
 
 		 156 aa  157  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.603471  normal  0.590888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1764  hypothetical protein  45.03 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117494 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6842  dehydratase  33.11 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3292  MaoC-like dehydratase  37.5 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  36.92 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00460  acyl dehydratase  39.57 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  33.79 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  34.67 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  34.4 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2124  MaoC domain protein dehydratase  31.34 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000215155  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  31.97 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1360  MaoC domain protein dehydratase  33.99 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0206053  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12521  oxidase regulatory-like protein  37.59 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  29.25 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  28.93 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  32.03 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2555  dehydratase  32.28 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4088  dehydratase  34.21 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0156653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1312  hypothetical protein  34.13 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3849  MaoC domain protein dehydratase  38.05 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  32.89 
 
 		 686 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1408  MaoC domain protein dehydratase  34.03 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  32.67 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  32.67 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  32.67 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  30.26 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5530  MaoC-like dehydratase  27.52 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1390  dehydratase  34.67 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.542578  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5894  dehydratase  27.52 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36432  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  29.01 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6403  dehydratase  26.85 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  30.14 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3318  MaoC domain protein dehydratase  35.07 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  31.29 
 
 		 681 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1834  MaoC-like dehydratase  34.92 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.420495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.29 
 
 		 681 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  29.33 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.29 
 
 		 681 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  31.29 
 
 		 679 aa  50.8  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  32.21 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3912  dehydratase  33.86 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.675333  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  34.31 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2103  MaoC domain protein dehydratase  34.87 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.61 
 
 		 681 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  28.35 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0813  hypothetical protein  27.95 
 
 		 343 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  32.37 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  29.25 
 
 		 344 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0611  dehydratase  31.3 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519544  normal  0.134756 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  31.3 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  30.67 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6530  dehydratase  26.35 
 
 		 152 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82464  normal  0.726262 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  28.85 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7491  MaoC-like dehydratase  38 
 
 		 165 aa  47.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  29.93 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6245  dehydratase  26.35 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  29.85 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  31.39 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1672  MaoC-like dehydratase  33.93 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4109  dehydratase  30.08 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1970  dehydratase  31.54 
 
 		 353 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961823 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  31.01 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  30.46 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4505  MaoC-like dehydratase  24.32 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.547822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  28.67 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  29.41 
 
 		 690 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6022  dehydratase  25.68 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  28.14 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1030  MaoC domain protein dehydratase  27.27 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329133  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  33.08 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 		 684 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2693  dehydratase  25 
 
 		 151 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.46 
 
 		 684 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2315  dehydratase  30.26 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0892641  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2898  MaoC domain protein dehydratase  24.65 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0566  dehydratase  28.17 
 
 		 344 aa  44.3  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.090067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3597  dehydratase  34.48 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30 
 
 		 684 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  29.92 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6129  dehydratase  25.68 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8223  MaoC domain protein dehydratase  29.92 
 
 		 150 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.924905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3000  MaoC domain-containing protein  25 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0628235  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  30.99 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5003  dehydratase  31.33 
 
 		 349 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5194  dehydratase  27.83 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1990  dehydratase  28.47 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  normal  0.551066 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  33.33 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3368  hypothetical protein  27.63 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.487735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3361  hypothetical protein  27.63 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.864271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3463  hypothetical protein  27.63 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5257  hypothetical protein  26.81 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  28.36 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.87 
 
 		 683 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5970  MaoC domain protein dehydratase  27.83 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0874793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>