169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4072 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4072  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00371629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3559  hypothetical protein  83.66 
 
 		 155 aa  261  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2996  hypothetical protein  68.29 
 
 		 165 aa  220  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0903588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0059  hypothetical protein  74.66 
 
 		 155 aa  216  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0206  hypothetical protein  64.29 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.603471  normal  0.590888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1037  dehydratase  53.42 
 
 		 163 aa  170  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1764  hypothetical protein  46.31 
 
 		 155 aa  136  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117494 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6842  dehydratase  44.67 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3292  MaoC-like dehydratase  33.33 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  34.81 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2124  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000215155  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  29.56 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  33.6 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  32 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  32.31 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  32.64 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  33.57 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  33.33 
 
 		 690 aa  61.2  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5257  hypothetical protein  31.65 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  35.29 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1360  MaoC domain protein dehydratase  33.1 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0206053  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  33.1 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3284  dehydratase  33.87 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1030  MaoC domain protein dehydratase  31.11 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329133  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3698  MaoC-related protein  31.47 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27276  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  34.27 
 
 		 686 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  33.09 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  31.25 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.51 
 
 		 695 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1013  MaoC-like dehydratase  30.14 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475086  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  31.62 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4109  dehydratase  30.15 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294085  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2898  MaoC domain protein dehydratase  28.79 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  28.24 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  33.55 
 
 		 679 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  31.11 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0013  dehydratase  27.21 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  33.96 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3597  dehydratase  32.17 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  30.6 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3000  MaoC domain-containing protein  27.46 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0628235  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  28 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  31.11 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1390  dehydratase  33.59 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.542578  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2693  dehydratase  27.46 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00460  acyl dehydratase  30.28 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  28 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1408  MaoC domain protein dehydratase  29.93 
 
 		 175 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2811  dehydratase  33.65 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894889 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1596  MaoC domain protein dehydratase  29.37 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.733518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.88 
 
 		 684 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 684 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1834  MaoC-like dehydratase  31.54 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.420495  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 684 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0611  dehydratase  32.11 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519544  normal  0.134756 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  31.19 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  30.67 
 
 		 681 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  28.79 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  30.6 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6753  dehydratase  31.73 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478036  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2683  dehydratase  28.57 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0972  dehydratase  28.47 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0875  MaoC domain protein dehydratase  26.95 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 		 681 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2533  dehydratase  29.79 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164666  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.67 
 
 		 681 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.61 
 
 		 684 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6530  dehydratase  26.06 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82464  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.64 
 
 		 685 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30.52 
 
 		 682 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  29.77 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6245  dehydratase  26.06 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.88 
 
 		 683 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3537  MaoC domain-containing protein  24.79 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5194  dehydratase  25.21 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.16 
 
 		 686 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  30 
 
 		 681 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  29.66 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1473  dehydratase  24.48 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  30.95 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2267  dehydratase  29.71 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1312  hypothetical protein  28.15 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3455  MaoC domain protein dehydratase  29.71 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3812  putative dehydratase  28.1 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5970  MaoC domain protein dehydratase  25.89 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0874793  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2117  MaoC domain-containing protein  29.93 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.456393 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2157  MaoC domain-containing protein  29.93 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  29.41 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7491  MaoC-like dehydratase  33.6 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  29.41 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3463  hypothetical protein  28.99 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3368  hypothetical protein  28.99 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.487735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3886  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  27.42 
 
 		 464 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3361  hypothetical protein  28.99 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.864271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3849  MaoC domain protein dehydratase  31.4 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  28.38 
 
 		 690 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3294  FkbR2  28.99 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.754163 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1055  dehydratase  32.69 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6022  dehydratase  25.35 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6403  dehydratase  26.06 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394709 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>