More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1023 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01581  fumarate hydratase (fumarase A), aerobic Class I  85.35 
 
 		 548 aa  994    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.733068  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03993  anaerobic class I fumarate hydratase (fumarase B)  85.35 
 
 		 548 aa  989    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2031  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  85.35 
 
 		 548 aa  994    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0136036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3870  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  85.35 
 
 		 548 aa  990    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3051  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  70.52 
 
 		 540 aa  825    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708755  normal  0.340068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0631  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  70.09 
 
 		 547 aa  797    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0994  fumarate hydratase, class I  69.52 
 
 		 541 aa  799    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1587  fumarate hydratase  85.53 
 
 		 548 aa  994    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.596697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1417  fumarate hydratase class I, anaerobic  76.37 
 
 		 548 aa  876    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.70407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5483  fumarase  62.1 
 
 		 551 aa  690    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0693  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  58 
 
 		 538 aa  665    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.635421  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01571  hypothetical protein  85.35 
 
 		 548 aa  994    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.900743  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1820  fumarate hydratase  85.35 
 
 		 548 aa  994    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0961  fumarate hydratase, class I  66.86 
 
 		 539 aa  736    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.426877  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1567  fumarate hydratase class I, anaerobic  84.8 
 
 		 548 aa  984    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0889  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  71.93 
 
 		 541 aa  827    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000151157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4555  fumarate hydratase class I, anaerobic  84.25 
 
 		 548 aa  961    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1831  fumarase  85.71 
 
 		 548 aa  994    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.640602  hitchhiker  0.002407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0162  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  62.03 
 
 		 538 aa  689    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19708  precursor of fumarase fumarase  62.02 
 
 		 567 aa  677    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473143  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2018  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  65.28 
 
 		 535 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0825  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate family  67.52 
 
 		 550 aa  803    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2615  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  69.7 
 
 		 542 aa  791    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000086832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4245  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  61.67 
 
 		 568 aa  670    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.201953  normal  0.0592114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1492  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  64.07 
 
 		 554 aa  731    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03954  hypothetical protein  85.35 
 
 		 548 aa  989    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3404  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  90.49 
 
 		 547 aa  1045    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0951  fumarate hydratase, class I  66.67 
 
 		 581 aa  736    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1337  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  65.17 
 
 		 548 aa  741    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2570  fumarase  71.38 
 
 		 541 aa  807    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.013592  normal  0.472366 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4676  fumarate hydratase  85.53 
 
 		 548 aa  992    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3082  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily subunit beta  63.18 
 
 		 551 aa  715    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2225  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  66.48 
 
 		 539 aa  731    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2560  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  82.6 
 
 		 549 aa  967    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0557449  normal  0.126998 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2206  fumarase  66.29 
 
 		 548 aa  738    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4363  fumarate hydratase  85.53 
 
 		 548 aa  992    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4695  fumarate hydratase class I, anaerobic  84.07 
 
 		 548 aa  959    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2068  fumarase  71.08 
 
 		 540 aa  827    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3762  fumarate hydratase, class I  61.94 
 
 		 555 aa  692    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2322  fumarate hydratase  85.16 
 
 		 548 aa  991    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4675  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  60.93 
 
 		 555 aa  664    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.63947  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1533  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  62.59 
 
 		 551 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4397  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  62.41 
 
 		 551 aa  697    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.617771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0713  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  64.91 
 
 		 550 aa  711    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0340597  normal  0.16476 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4646  fumarate hydratase class I, anaerobic  84.07 
 
 		 548 aa  961    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1651  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  70.07 
 
 		 541 aa  800    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000020704  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1708  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  61.47 
 
 		 551 aa  689    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1798  fumarate hydratase  85.35 
 
 		 548 aa  993    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.773214  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3258  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  89.76 
 
 		 547 aa  1046    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000853495  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4564  fumarate hydratase  84.25 
 
 		 548 aa  961    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4646  fumarate hydratase class I, anaerobic  84.07 
 
 		 548 aa  959    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0933  fumarate hydratase, class I  90.68 
 
 		 547 aa  1047    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.140694  normal  0.173179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24490  fumarase  62.01 
 
 		 567 aa  711    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208028  normal  0.69636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4588  fumarate hydratase class I, anaerobic  85.35 
 
 		 548 aa  991    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0881  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  61.61 
 
 		 534 aa  714    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1080  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  63.77 
 
 		 546 aa  729    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1636  fumarate hydratase class I, anaerobic  84.8 
 
 		 548 aa  983    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901964 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3285  fumarase  63.79 
 
 		 534 aa  732    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1706  fumarate hydratase class I, anaerobic  84.8 
 
 		 548 aa  993    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.142614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1809  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  72.2 
 
 		 540 aa  837    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3371  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  71.75 
 
 		 541 aa  823    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86934  predicted protein  61.57 
 
 		 560 aa  696    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5566  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  64.07 
 
 		 548 aa  736    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1577  fumarate hydratase class I, anaerobic  84.62 
 
 		 548 aa  982    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.551964 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3905  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  85.35 
 
 		 548 aa  991    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2336  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  72.32 
 
 		 538 aa  828    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.801629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3238  fumarase  63.27 
 
 		 535 aa  711    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5636  fumarate hydratase  85.16 
 
 		 548 aa  988    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0749  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  70.63 
 
 		 541 aa  810    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000017058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8500  fumarate hydratase, class I  61.8 
 
 		 550 aa  697    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1875  fumarate hydratase class I, anaerobic  84.8 
 
 		 548 aa  984    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.27379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1061  fumarase  61.44 
 
 		 571 aa  702    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2916  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  62.99 
 
 		 538 aa  694    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36455 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2144  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  74.64 
 
 		 548 aa  851    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.207467  normal  0.384871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3124  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  64.18 
 
 		 564 aa  714    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00427914  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1149  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  61.15 
 
 		 554 aa  701    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.691464  normal  0.943485 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2018  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  85.35 
 
 		 548 aa  993    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1888  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  72.39 
 
 		 540 aa  840    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1023  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  100 
 
 		 547 aa  1137    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0745  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  67.52 
 
 		 550 aa  803    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.517956 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2076  fumarate hydratase protein class I  64.77 
 
 		 534 aa  721    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4022  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  86.45 
 
 		 548 aa  1010    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00935684  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3271  fumarate hydratase, class I  90.49 
 
 		 547 aa  1046    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2239  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  65.09 
 
 		 535 aa  730    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.747448 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3184  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  88.64 
 
 		 549 aa  1029    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.493682  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0786  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  98.9 
 
 		 547 aa  1127    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6383  hydro-lyase Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, subunit beta  64.15 
 
 		 547 aa  727    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1687  fumarate hydratase  85.35 
 
 		 548 aa  993    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.713112  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2412  fumarase  33.47 
 
 		 505 aa  206  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.2772  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2334  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  33.12 
 
 		 505 aa  206  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449013  normal  0.0431842 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01949  fumarate hydratase, class I  30.95 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0117439  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1977  fumarate hydratase  31.18 
 
 		 512 aa  201  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.146696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1628  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  31.43 
 
 		 509 aa  200  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00231354  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2583  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha protein  32.34 
 
 		 516 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.604027  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2883  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  32.54 
 
 		 516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234305 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1912  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  32.97 
 
 		 520 aa  198  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00626493  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3613  putative fumarate hydratase, class I  30.92 
 
 		 507 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.985356  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003161  fumarate hydratase class I aerobic  31.57 
 
 		 505 aa  196  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4672  fumarase  30.55 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0151007  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2035  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  32.55 
 
 		 504 aa  195  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>