More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_86934 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01581  fumarate hydratase (fumarase A), aerobic Class I  63.06 
 
 
548 aa  712    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.733068  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03993  anaerobic class I fumarate hydratase (fumarase B)  62.5 
 
 
548 aa  700    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2031  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  63.06 
 
 
548 aa  712    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0136036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3870  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  62.31 
 
 
548 aa  698    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1875  fumarate hydratase class I, anaerobic  62.59 
 
 
548 aa  698    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.27379  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0693  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  59.88 
 
 
538 aa  647    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.635421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0994  fumarate hydratase, class I  58.74 
 
 
541 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19708  precursor of fumarase fumarase  67.41 
 
 
567 aa  759    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473143  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1417  fumarate hydratase class I, anaerobic  62.5 
 
 
548 aa  699    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.70407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1492  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  68.54 
 
 
554 aa  773    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1577  fumarate hydratase class I, anaerobic  62.13 
 
 
548 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.551964 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4695  fumarate hydratase class I, anaerobic  62.22 
 
 
548 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1651  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  58.85 
 
 
541 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000020704  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1888  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  59.48 
 
 
540 aa  651    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0961  fumarate hydratase, class I  65.97 
 
 
539 aa  728    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.426877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3905  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  62.5 
 
 
548 aa  699    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1149  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  66.23 
 
 
554 aa  726    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.691464  normal  0.943485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3184  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  61.19 
 
 
549 aa  692    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.493682  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4245  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  66.48 
 
 
568 aa  721    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.201953  normal  0.0592114 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0933  fumarate hydratase, class I  62.13 
 
 
547 aa  706    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.140694  normal  0.173179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24490  fumarase  67.75 
 
 
567 aa  750    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208028  normal  0.69636 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5636  fumarate hydratase  62.31 
 
 
548 aa  697    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4675  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  66.42 
 
 
555 aa  718    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.63947  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3082  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily subunit beta  71.97 
 
 
551 aa  784    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2018  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  68.6 
 
 
535 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4646  fumarate hydratase class I, anaerobic  62.59 
 
 
548 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01571  hypothetical protein  63.06 
 
 
548 aa  712    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.900743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5483  fumarase  66.86 
 
 
551 aa  723    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2570  fumarase  60.45 
 
 
541 aa  666    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.013592  normal  0.472366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4363  fumarate hydratase  62.5 
 
 
548 aa  699    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2239  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  69.8 
 
 
535 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.747448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3051  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  60.97 
 
 
540 aa  667    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708755  normal  0.340068 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3271  fumarate hydratase, class I  62.31 
 
 
547 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2560  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  61.28 
 
 
549 aa  695    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0557449  normal  0.126998 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2206  fumarase  68.63 
 
 
548 aa  744    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4022  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  61.24 
 
 
548 aa  692    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00935684  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2068  fumarase  59.48 
 
 
540 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3762  fumarate hydratase, class I  66.67 
 
 
555 aa  723    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1636  fumarate hydratase class I, anaerobic  62.31 
 
 
548 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901964 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1023  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  61.57 
 
 
547 aa  696    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0889  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  61.78 
 
 
541 aa  666    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000151157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1533  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  65.28 
 
 
551 aa  715    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2615  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  59.14 
 
 
542 aa  649    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000086832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03954  hypothetical protein  62.5 
 
 
548 aa  700    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2916  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  67.74 
 
 
538 aa  743    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1708  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  65.84 
 
 
551 aa  719    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0745  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  59.12 
 
 
550 aa  653    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.517956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1706  fumarate hydratase class I, anaerobic  62.5 
 
 
548 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.142614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3258  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  62.31 
 
 
547 aa  706    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000853495  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4564  fumarate hydratase  62.22 
 
 
548 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4676  fumarate hydratase  62.5 
 
 
548 aa  699    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2322  fumarate hydratase  63.06 
 
 
548 aa  711    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387044  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0631  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  61.92 
 
 
547 aa  691    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1798  fumarate hydratase  63.06 
 
 
548 aa  711    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.773214  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3285  fumarase  65.12 
 
 
534 aa  700    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4588  fumarate hydratase class I, anaerobic  62.69 
 
 
548 aa  704    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1587  fumarate hydratase  62.87 
 
 
548 aa  711    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.596697  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0786  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  61.19 
 
 
547 aa  698    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3404  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  62.13 
 
 
547 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0881  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  63.78 
 
 
534 aa  693    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44568  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1809  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  59.48 
 
 
540 aa  652    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1831  fumarase  61.38 
 
 
548 aa  699    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.640602  hitchhiker  0.002407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2336  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  63.72 
 
 
538 aa  705    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.801629  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3238  fumarase  67.14 
 
 
535 aa  724    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2018  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  63.06 
 
 
548 aa  711    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0749  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  59.96 
 
 
541 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000017058  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1061  fumarase  68.73 
 
 
571 aa  758    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2076  fumarate hydratase protein class I  69.62 
 
 
534 aa  754    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0951  fumarate hydratase, class I  65.77 
 
 
581 aa  729    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4397  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  68.4 
 
 
551 aa  722    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.617771  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4646  fumarate hydratase class I, anaerobic  62.22 
 
 
548 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1687  fumarate hydratase  63.06 
 
 
548 aa  711    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.713112  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2225  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  66.28 
 
 
539 aa  727    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1567  fumarate hydratase class I, anaerobic  62.31 
 
 
548 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3371  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  61.58 
 
 
541 aa  663    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0162  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  65.04 
 
 
538 aa  707    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5566  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  68.71 
 
 
548 aa  756    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4555  fumarate hydratase class I, anaerobic  62.22 
 
 
548 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1080  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  71.95 
 
 
546 aa  790    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1820  fumarate hydratase  63.06 
 
 
548 aa  712    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1337  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  68.07 
 
 
548 aa  759    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8500  fumarate hydratase, class I  68.56 
 
 
550 aa  753    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3124  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  70.02 
 
 
564 aa  764    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00427914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6383  hydro-lyase Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, subunit beta  67.5 
 
 
547 aa  735    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0713  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  69.08 
 
 
550 aa  739    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0340597  normal  0.16476 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2144  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  63.75 
 
 
548 aa  696    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.207467  normal  0.384871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0825  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate family  58.54 
 
 
550 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86934  predicted protein  100 
 
 
560 aa  1162    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120062  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1941  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  32.74 
 
 
507 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757012  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1413  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  32.96 
 
 
507 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0515679  normal  0.0934254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3136  fumarase  32.74 
 
 
520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119324  normal  0.0284437 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2219  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  32.38 
 
 
507 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00489886  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1382  fumarase  33.41 
 
 
507 aa  187  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2112  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  32.16 
 
 
507 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775918  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1082  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  32.3 
 
 
507 aa  186  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5523  fumarase  32.16 
 
 
507 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209704  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2020  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  31.88 
 
 
511 aa  186  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244289  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5883  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  32.16 
 
 
507 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2233  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  32.16 
 
 
507 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102224  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2194  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  32.16 
 
 
507 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>