More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1287 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1287  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  100 
 
 
576 aa  1139    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.592615  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3713  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.39 
 
 
540 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3447  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.39 
 
 
540 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471673 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3623  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.67 
 
 
539 aa  452  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0168629  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.84 
 
 
598 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.840154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  48.12 
 
 
539 aa  425  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2476  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.42 
 
 
578 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1384  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.42 
 
 
578 aa  415  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0617713  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5266  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.53 
 
 
543 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0502  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.69 
 
 
542 aa  405  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.321339  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0437  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.69 
 
 
542 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0958706  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2656  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.45 
 
 
535 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2228  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.27 
 
 
559 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1851  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.78 
 
 
559 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.059579 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1008  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.41 
 
 
535 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.757465  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3291  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.42 
 
 
601 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.433006  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1522  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.85 
 
 
573 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0664995  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3533  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.58 
 
 
543 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.81 
 
 
544 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3907  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.91 
 
 
572 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3512  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.1 
 
 
559 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523861  hitchhiker  0.00169463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1603  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.74 
 
 
568 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0032  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.4 
 
 
540 aa  379  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.81 
 
 
559 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.260298  normal  0.224731 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1589  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.97 
 
 
554 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3473  monovalent cation/proton antiporter, MnhD/PhaD subunit  41.17 
 
 
558 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3254  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.62 
 
 
561 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0445777  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3312  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.76 
 
 
559 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.65 
 
 
561 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.354108  hitchhiker  0.00768927 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5079  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.65 
 
 
551 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.793582 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.41 
 
 
541 aa  364  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.85253  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5154  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.83 
 
 
534 aa  331  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3807  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.36 
 
 
506 aa  293  8e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.5869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3984  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.71 
 
 
503 aa  292  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.88 
 
 
511 aa  291  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.78206  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1540  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.3 
 
 
540 aa  283  5.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.010926 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.42 
 
 
503 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.94 
 
 
511 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0994  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.42 
 
 
503 aa  270  7e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.949709  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04211  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.69 
 
 
516 aa  266  5.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.67 
 
 
503 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104393  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0674  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.1 
 
 
511 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1102  NADH dehydrogenase (quinone)  40.25 
 
 
507 aa  266  8.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.164573  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0699  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.44 
 
 
530 aa  262  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1357  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.33 
 
 
503 aa  263  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.726443  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3717  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.51 
 
 
539 aa  261  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0901  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.35 
 
 
503 aa  261  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2851  NADH dehydrogenase (quinone)  35.78 
 
 
505 aa  257  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19550  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.12 
 
 
499 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216033  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0150  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.73 
 
 
511 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1128  NADH dehydrogenase (quinone)  36.14 
 
 
540 aa  251  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.556203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0061  NADH dehydrogenase (quinone)  36.38 
 
 
508 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36 
 
 
510 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0135154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.55 
 
 
505 aa  244  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19533  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50710  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.79 
 
 
499 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.18 
 
 
501 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0476084  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4322  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.21 
 
 
499 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891162  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0495  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40 
 
 
504 aa  224  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1680  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  36.98 
 
 
511 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.962527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2486  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.99 
 
 
502 aa  211  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  31.53 
 
 
505 aa  200  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  31.47 
 
 
498 aa  194  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3871  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.98 
 
 
539 aa  193  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  32.24 
 
 
504 aa  188  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.76 
 
 
562 aa  185  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.79 
 
 
565 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.58 
 
 
501 aa  183  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  30.69 
 
 
500 aa  183  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  29.06 
 
 
498 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.66 
 
 
538 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  31.69 
 
 
525 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.41 
 
 
538 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  30.65 
 
 
501 aa  181  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.85 
 
 
543 aa  180  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  31.14 
 
 
500 aa  180  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  29.84 
 
 
500 aa  180  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.85 
 
 
535 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0596  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.85 
 
 
535 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.395006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.85 
 
 
535 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.39 
 
 
500 aa  176  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2871  NADH dehydrogenase (quinone)  30.32 
 
 
490 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  29.58 
 
 
504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.55 
 
 
513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35440  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  30.67 
 
 
540 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1772  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  30.22 
 
 
499 aa  174  5e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.49 
 
 
525 aa  174  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  28.39 
 
 
505 aa  172  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0968  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.49 
 
 
498 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25180  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  30.36 
 
 
526 aa  172  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0648794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0949  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.49 
 
 
498 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4892  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.72 
 
 
552 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.08 
 
 
538 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.16 
 
 
545 aa  172  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  30.1 
 
 
502 aa  171  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.46 
 
 
523 aa  170  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000590255  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0867  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.44 
 
 
519 aa  170  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.335998  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  30.22 
 
 
498 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2712  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.07 
 
 
574 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0535  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.98 
 
 
498 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0348  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.68 
 
 
547 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0328119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>