More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1589 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1589  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  100 
 
 
554 aa  1078    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0502  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.76 
 
 
542 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.321339  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0437  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.38 
 
 
542 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0958706  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3533  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.48 
 
 
543 aa  461  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5266  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  49.73 
 
 
543 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1008  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  49.82 
 
 
535 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.757465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1851  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.22 
 
 
559 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.059579 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2656  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  48.36 
 
 
535 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.21 
 
 
544 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2228  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.75 
 
 
559 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3254  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.23 
 
 
561 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0445777  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.24 
 
 
598 aa  425  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.840154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.46 
 
 
541 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.85253  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  48.85 
 
 
539 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3512  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.75 
 
 
559 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523861  hitchhiker  0.00169463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1384  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.15 
 
 
578 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0617713  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.76 
 
 
559 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.260298  normal  0.224731 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1522  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.46 
 
 
573 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0664995  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2476  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.15 
 
 
578 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3473  monovalent cation/proton antiporter, MnhD/PhaD subunit  45.31 
 
 
558 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3312  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.29 
 
 
559 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3291  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.58 
 
 
601 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.433006  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1603  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.79 
 
 
568 aa  409  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0032  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.29 
 
 
540 aa  402  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5079  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.74 
 
 
551 aa  398  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.793582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.93 
 
 
561 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.354108  hitchhiker  0.00768927 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1287  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.5 
 
 
576 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.592615  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3623  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.24 
 
 
539 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0168629  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3713  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.14 
 
 
540 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3447  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.32 
 
 
540 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3907  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.01 
 
 
572 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5154  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.4 
 
 
534 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3984  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.81 
 
 
503 aa  330  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1540  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.49 
 
 
540 aa  323  4e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.010926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2851  NADH dehydrogenase (quinone)  40.64 
 
 
505 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.56 
 
 
511 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3807  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.32 
 
 
506 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.5869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0674  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.28 
 
 
511 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1102  NADH dehydrogenase (quinone)  42.71 
 
 
507 aa  300  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.164573  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.29 
 
 
505 aa  299  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19533  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0061  NADH dehydrogenase (quinone)  40.71 
 
 
508 aa  296  5e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1357  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.02 
 
 
503 aa  296  7e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.726443  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.25 
 
 
503 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104393  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.67 
 
 
503 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0994  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.13 
 
 
503 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.949709  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04211  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.85 
 
 
516 aa  289  9e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0150  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.04 
 
 
511 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0699  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.61 
 
 
530 aa  286  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.68 
 
 
510 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0135154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.22 
 
 
511 aa  278  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.78206  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3717  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.84 
 
 
539 aa  278  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1128  NADH dehydrogenase (quinone)  43.03 
 
 
540 aa  277  3e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.556203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50710  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.77 
 
 
499 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564704 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0901  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.54 
 
 
503 aa  272  9e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19550  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.1 
 
 
499 aa  270  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216033  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0495  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  46.3 
 
 
504 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1680  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.57 
 
 
511 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.962527  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4322  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.21 
 
 
499 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2486  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.07 
 
 
502 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.84 
 
 
501 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0476084  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.22 
 
 
538 aa  223  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.63 
 
 
538 aa  223  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  32.17 
 
 
505 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  30.48 
 
 
498 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3871  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.2 
 
 
539 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  31.97 
 
 
500 aa  213  9e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.52 
 
 
535 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.52 
 
 
535 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0596  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.52 
 
 
535 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.395006 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  31.08 
 
 
505 aa  208  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  32.47 
 
 
498 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35440  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  32.26 
 
 
540 aa  208  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  31.84 
 
 
500 aa  207  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.99 
 
 
501 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2925  NADH dehydrogenase (quinone)  33.71 
 
 
505 aa  205  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0483803  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.98 
 
 
538 aa  205  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  29.52 
 
 
500 aa  203  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1160  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.12 
 
 
495 aa  203  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.62 
 
 
545 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  29.47 
 
 
498 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  30.74 
 
 
525 aa  200  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.49 
 
 
543 aa  198  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.07 
 
 
523 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000590255  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 
501 aa  196  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  31.05 
 
 
504 aa  196  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4892  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.73 
 
 
552 aa  196  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.99 
 
 
513 aa  196  9e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.21 
 
 
562 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.62 
 
 
565 aa  194  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  32.72 
 
 
502 aa  194  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32 
 
 
525 aa  193  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  30.59 
 
 
504 aa  193  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2437  NADH dehydrogenase (quinone)  31.08 
 
 
530 aa  192  9e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.366515 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  30.48 
 
 
511 aa  187  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0348  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.21 
 
 
547 aa  186  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0328119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.91 
 
 
500 aa  183  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25180  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  30.61 
 
 
526 aa  182  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0648794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0535  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.7 
 
 
498 aa  179  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6653  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  30.8 
 
 
529 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3816  NADH dehydrogenase (quinone)  33.7 
 
 
509 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.818014  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>