More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2656 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2656  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  100 
 
 
535 aa  1040    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1008  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  87.85 
 
 
535 aa  857    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.757465  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  61.52 
 
 
539 aa  559  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  60.77 
 
 
544 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0502  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  57.88 
 
 
542 aa  548  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.321339  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0437  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  57.88 
 
 
542 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0958706  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3533  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  58.26 
 
 
543 aa  545  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5266  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  56.33 
 
 
543 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0032  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.24 
 
 
540 aa  498  1e-140  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.23 
 
 
541 aa  490  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.85253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1522  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  52.01 
 
 
573 aa  485  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0664995  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1384  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.2 
 
 
578 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0617713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2476  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.38 
 
 
578 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2228  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.18 
 
 
559 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1851  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.44 
 
 
559 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.059579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3473  monovalent cation/proton antiporter, MnhD/PhaD subunit  50.72 
 
 
558 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  48.91 
 
 
598 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.840154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3254  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  50.36 
 
 
561 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0445777  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3713  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.95 
 
 
540 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3447  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.95 
 
 
540 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3512  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  50.63 
 
 
559 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.523861  hitchhiker  0.00169463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3291  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  50.82 
 
 
601 aa  463  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.433006  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3907  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.99 
 
 
572 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.62 
 
 
559 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.260298  normal  0.224731 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3623  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  53.06 
 
 
539 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0168629  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1603  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  50.27 
 
 
568 aa  458  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3312  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  51.01 
 
 
559 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5079  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  49.9 
 
 
551 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.793582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4614  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  49.9 
 
 
561 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.354108  hitchhiker  0.00768927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1589  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  47.51 
 
 
554 aa  434  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1287  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.45 
 
 
576 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.592615  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5154  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  49.34 
 
 
534 aa  398  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1540  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.44 
 
 
540 aa  343  5e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.010926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2851  NADH dehydrogenase (quinone)  40.37 
 
 
505 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3807  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.76 
 
 
506 aa  332  8e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.5869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1102  NADH dehydrogenase (quinone)  44.97 
 
 
507 aa  326  6e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.164573  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0674  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.95 
 
 
511 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3984  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.42 
 
 
503 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.41 
 
 
511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0901  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.09 
 
 
503 aa  312  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0994  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.58 
 
 
503 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.949709  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.01 
 
 
503 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104393  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.16 
 
 
503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1357  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.19 
 
 
503 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.726443  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0150  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.54 
 
 
511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0699  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.18 
 
 
530 aa  303  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.5 
 
 
510 aa  298  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0135154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3816  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.22 
 
 
505 aa  293  7e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19533  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3717  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.44 
 
 
539 aa  292  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3731  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.16 
 
 
511 aa  290  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.78206  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0061  NADH dehydrogenase (quinone)  41.18 
 
 
508 aa  286  5e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04211  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  39.48 
 
 
516 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50710  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  44.44 
 
 
499 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19550  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  41.67 
 
 
499 aa  273  8.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216033  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1128  NADH dehydrogenase (quinone)  38.88 
 
 
540 aa  272  9e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.556203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0495  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  43.46 
 
 
504 aa  270  5e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  40.78 
 
 
501 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0476084  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4322  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  42.52 
 
 
499 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891162  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1680  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  38.72 
 
 
511 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.962527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2486  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.44 
 
 
502 aa  243  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35440  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  33.58 
 
 
540 aa  233  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.708783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0210  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.53 
 
 
525 aa  225  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.924509  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0077  NADH dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 
500 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3692  NADH dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 
500 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0044  NADH dehydrogenase (quinone)  33.4 
 
 
525 aa  216  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.33239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.76 
 
 
565 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2525  NADH dehydrogenase (quinone)  34.32 
 
 
505 aa  216  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0751  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.29 
 
 
501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00659406  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1771  NADH dehydrogenase (quinone)  32.26 
 
 
500 aa  214  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2093  NADH dehydrogenase (quinone)  31.64 
 
 
501 aa  213  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.156897  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0574  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.26 
 
 
535 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0097  NADH dehydrogenase (quinone)  30.06 
 
 
505 aa  211  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.988192  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0164  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  35.1 
 
 
538 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.26 
 
 
535 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0596  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.26 
 
 
535 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.395006 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3221  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.3 
 
 
500 aa  210  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0980  NADH dehydrogenase (quinone)  32.65 
 
 
502 aa  209  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.723018  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2437  NADH dehydrogenase (quinone)  32.18 
 
 
530 aa  208  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.366515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.35 
 
 
545 aa  207  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0742  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  34.28 
 
 
538 aa  206  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.778742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  32.83 
 
 
498 aa  206  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805314  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1123  putative NADH dehydrogenase  32.21 
 
 
498 aa  206  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0103051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3871  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.22 
 
 
539 aa  205  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.24 
 
 
513 aa  203  7e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2858  NADH dehydrogenase (quinone)  31.04 
 
 
504 aa  203  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356875  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2032  NADH dehydrogenase (quinone)  30.39 
 
 
504 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000416  Na(+) H(+) antiporter subunit D  30.29 
 
 
498 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4892  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.96 
 
 
552 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.405552  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25180  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  31.73 
 
 
526 aa  199  7e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0648794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2341  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.81 
 
 
504 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0669  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.09 
 
 
538 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1160  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  37.56 
 
 
495 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0731  quinone dependent NADH dehydrogenase  32.95 
 
 
511 aa  196  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156813  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0949  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.27 
 
 
498 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0968  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.27 
 
 
498 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6653  Na(+)/H(+) antiporter subunit D  34.23 
 
 
529 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3185  NADH dehydrogenase (quinone)  33.53 
 
 
552 aa  194  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.98 
 
 
562 aa  194  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3816  NADH dehydrogenase (quinone)  33.02 
 
 
509 aa  193  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.818014  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.39 
 
 
543 aa  193  9e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>