71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0960 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0960  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2476  CRISPR-associated protein Cas5 family  61.48 
 
 		 271 aa  296  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2987  CRISPR-associated Cas5 family protein  52.19 
 
 		 259 aa  245  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0230  CRISPR-associated Cas5e family protein  47.49 
 
 		 260 aa  215  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0597  CRISPR-associated Cas5e family protein  41.37 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000345339  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3544  CRISPR-associated Cas5 family protein  47.03 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725088 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1604  CRISPR-associated protein Cas5 family  46.5 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.421198  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0401  CRISPR-associated protein Cas5 family  44.94 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0308989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3587  CRISPR-associated protein Cas5 family  47.01 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3094  CRISPR-associated protein Cas5  46.41 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.18699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3150  CRISPR-associated Cas5 family protein  46.41 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.635269 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3059  CRISPR-associated Cas5 family protein  42.02 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2885  CRISPR-associated Cas5 family protein  42.44 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.582573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4010  CRISPR-associated protein Cas5  42.02 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00869  CRISPR-associated protein Cas5 family  43.56 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0171  CRISPR-associated Cas5e family protein  41.46 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3318  CRISPR-associated Cas5 family protein  38.27 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295879  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1810  CRISPR-associated Cas5 family protein  38.27 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0861  CRISPR-associated Cas5e family protein  43.68 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3068  CRISPR-associated protein Cas5  43.57 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3251  CRISPR-associated protein Cas5  42.04 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.696128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0424  CRISPR-associated protein Cas5 family  36.29 
 
 		 260 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00796359  normal  0.029859 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3134  CRISPR-associated protein  42.04 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5411  CRISPR-associated protein Cas5 family  36.19 
 
 		 273 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0731304  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1377  CRISPR-associated Cas5e family protein  43.95 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00215137  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3117  CRISPR-associated protein Cas5  40 
 
 		 213 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17170  CRISPR-associated protein Cas5  37.8 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1590  CRISPR-associated Cas5 family protein  33.91 
 
 		 217 aa  88.6  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.468726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0944  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.31 
 
 		 273 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3051  CRISPR-associated protein Cas5 family  38.75 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000204207  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2442  CRISPR-associated protein Cas5 family  35.62 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844611 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0763  CRISPR system CASCADE complex protein CasD  32.93 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2576  CRISPR-associated Cas5 family protein  33.12 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0636812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1975  CRISPR-associated Cas5 family protein  33.33 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.40631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2896  CRISPR-associated Cas5 family protein  37.5 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.586448  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0955  CRISPR-associated Cas5 family protein  38.1 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0931  CRISPR-associated protein Cas5 family  38.1 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17320  CRISPR-associated protein, Cas5e family  36.02 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1532  Cas5 family CRISPR-associated protein  30.74 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0481133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0647  CRISPR-associated Cas5 family protein  30.05 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2232  CRISPR-associated protein Cas5 family  34.12 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13900  CRISPR-associated protein Cas5  33.54 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.872767  normal  0.507161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0021  CRISPR-associated Cas5e family protein  35.19 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.538245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2683  CRISPR-associated protein Cas5 family  33.54 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0985  CRISPR-associated protein Cas5 family  35.33 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3906  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.68 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00264254  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1899  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.28 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2633  CRISPR-associated Cas5e family protein  32.49 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.405174  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1589  CRISPR-associated Cas5e family protein  33.33 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1388  CRISPR-associated Cas5e family protein  36.88 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17210  CRISPR-associated protein, CT1976  38.06 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3757  CRISPR-associated Cas5e family protein  35.62 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.364301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2339  CRISPR-associated Cas5 family protein  34.59 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1597  CRISPR-associated Cas5e family protein  32.04 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0035372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0831  CRISPR-associated Cas5 family protein  30.54 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.842897  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0484  CRISPR-associated protein Cas5 family  33.33 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.325433  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4090  CRISPR-associated protein Cas5 family  27.31 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.509678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1234  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.47 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00117259  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0951  CRISPR-associated Cas5 family protein  30.67 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0906811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1284  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.91 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3015  Cas5 family CRISPR-associated protein  32.47 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000337648  normal  0.0242997 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0932  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.27 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.767604  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3218  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.53 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.960254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0345  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.33 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.45 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3201  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.03 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0927  CRISPR-associated protein Cas5 family  27.73 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2675  CRISPR-associated Cas5 family protein  26.51 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  27.88 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1414  CRISPR-associated protein Cas5 family  24.39 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.136655  normal  0.0675969 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2163  CRISPR-associated protein Cas5 family  25.77 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.193051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>