43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0345 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0345  CRISPR-associated Cas5e family protein  100 
 
 		 249 aa  496  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3218  CRISPR-associated protein Cas5 family  55.6 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.960254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2232  CRISPR-associated protein Cas5 family  50 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0484  CRISPR-associated protein Cas5 family  42.52 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.325433  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3201  CRISPR-associated protein Cas5 family  43.3 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  51.55 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  41.67 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0932  CRISPR-associated Cas5e family protein  37.7 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.767604  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0951  CRISPR-associated Cas5 family protein  40.32 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0906811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2987  CRISPR-associated Cas5 family protein  26.92 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0597  CRISPR-associated Cas5e family protein  28.87 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000345339  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0171  CRISPR-associated Cas5e family protein  30.85 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0230  CRISPR-associated Cas5e family protein  30.63 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0021  CRISPR-associated Cas5e family protein  31.52 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.538245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0985  CRISPR-associated protein Cas5 family  35.5 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00869  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.72 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0944  CRISPR-associated protein Cas5 family  35.37 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0861  CRISPR-associated Cas5e family protein  30.12 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5411  CRISPR-associated protein Cas5 family  34.36 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0731304  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0927  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.02 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1388  CRISPR-associated Cas5e family protein  30.39 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17320  CRISPR-associated protein, Cas5e family  30.69 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3059  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.49 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3318  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.45 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295879  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4010  CRISPR-associated protein Cas5  29.49 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3587  CRISPR-associated protein Cas5 family  33.94 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2675  CRISPR-associated Cas5 family protein  25 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2885  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.56 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.582573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1810  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.19 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0647  CRISPR-associated Cas5 family protein  30.32 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1899  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.92 
 
 		 230 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2633  CRISPR-associated Cas5e family protein  34.18 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.405174  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17170  CRISPR-associated protein Cas5  30.25 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3051  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.14 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000204207  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0960  hypothetical protein  27.24 
 
 		 244 aa  45.4  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0907  CRISPR-associated protein Cas5 family  27.54 
 
 		 238 aa  45.4  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2163  CRISPR-associated protein Cas5 family  27.61 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.193051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0955  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.67 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3544  CRISPR-associated Cas5 family protein  25.93 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725088 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0931  CRISPR-associated protein Cas5 family  27.67 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2442  CRISPR-associated protein Cas5 family  26.71 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2896  CRISPR-associated Cas5 family protein  26.22 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.586448  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1377  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.42 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00215137  normal  0.352446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>