67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17170 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17170  CRISPR-associated protein Cas5  100 
 
 		 255 aa  513  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1975  CRISPR-associated Cas5 family protein  50.98 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.40631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1589  CRISPR-associated Cas5e family protein  48.19 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0944  CRISPR-associated protein Cas5 family  47.47 
 
 		 273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13900  CRISPR-associated protein Cas5  38.87 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.872767  normal  0.507161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1597  CRISPR-associated Cas5e family protein  40.69 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0035372  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17320  CRISPR-associated protein, Cas5e family  43.51 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1284  CRISPR-associated protein Cas5 family  39.91 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0021  CRISPR-associated Cas5e family protein  42.21 
 
 		 276 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.538245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1899  CRISPR-associated protein Cas5 family  40.17 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2683  CRISPR-associated protein Cas5 family  40 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0985  CRISPR-associated protein Cas5 family  47.24 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1532  Cas5 family CRISPR-associated protein  36.55 
 
 		 232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0481133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3051  CRISPR-associated protein Cas5 family  46.36 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000204207  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3906  CRISPR-associated protein Cas5 family  36.48 
 
 		 245 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00264254  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2442  CRISPR-associated protein Cas5 family  41.14 
 
 		 215 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2576  CRISPR-associated Cas5 family protein  38.05 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0636812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3757  CRISPR-associated Cas5e family protein  38.84 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.364301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17210  CRISPR-associated protein, CT1976  48.05 
 
 		 217 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2633  CRISPR-associated Cas5e family protein  41.01 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.405174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2339  CRISPR-associated Cas5 family protein  36.32 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3015  Cas5 family CRISPR-associated protein  40.44 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000337648  normal  0.0242997 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0763  CRISPR system CASCADE complex protein CasD  34.81 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0647  CRISPR-associated Cas5 family protein  36.5 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2675  CRISPR-associated Cas5 family protein  33.48 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4090  CRISPR-associated protein Cas5 family  35.59 
 
 		 216 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.509678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1234  CRISPR-associated protein Cas5 family  44.37 
 
 		 232 aa  99.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00117259  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0907  CRISPR-associated protein Cas5 family  34.36 
 
 		 238 aa  98.6  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0831  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.6 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.842897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0955  CRISPR-associated Cas5 family protein  38.02 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1414  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.97 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.136655  normal  0.0675969 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2896  CRISPR-associated Cas5 family protein  36.98 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.586448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1388  CRISPR-associated Cas5e family protein  36.9 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0931  CRISPR-associated protein Cas5 family  37.5 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0861  CRISPR-associated Cas5e family protein  33.94 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2163  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.24 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.193051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1590  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.88 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.468726 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2987  CRISPR-associated Cas5 family protein  34.15 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0927  CRISPR-associated protein Cas5 family  33.33 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2476  CRISPR-associated protein Cas5 family  38.04 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0960  hypothetical protein  37.8 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0171  CRISPR-associated Cas5e family protein  33.92 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2232  CRISPR-associated protein Cas5 family  34.21 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0230  CRISPR-associated Cas5e family protein  31.9 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  34.36 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0597  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.41 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000345339  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1604  CRISPR-associated protein Cas5 family  36.81 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.421198  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0932  CRISPR-associated Cas5e family protein  32.24 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.767604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0484  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.05 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.325433  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0951  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.22 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0906811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3544  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.19 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5411  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.52 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0731304  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.9 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2828  hypothetical protein  35.71 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3150  CRISPR-associated Cas5 family protein  33.53 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.635269 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1377  CRISPR-associated Cas5e family protein  31.54 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00215137  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3059  CRISPR-associated Cas5 family protein  30.92 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3587  CRISPR-associated protein Cas5 family  38.75 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4010  CRISPR-associated protein Cas5  30.92 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2885  CRISPR-associated Cas5 family protein  30.26 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.582573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3094  CRISPR-associated protein Cas5  33.33 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.18699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0401  CRISPR-associated protein Cas5 family  38.55 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0308989  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1810  CRISPR-associated Cas5 family protein  28.75 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3218  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.74 
 
 		 228 aa  52  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.960254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3318  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.85 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295879  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0424  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.93 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00796359  normal  0.029859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00869  CRISPR-associated protein Cas5 family  35.33 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>