56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2163 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2163  CRISPR-associated protein Cas5 family  100 
 
 		 233 aa  484  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.193051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1414  CRISPR-associated protein Cas5 family  82.72 
 
 		 243 aa  423  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.136655  normal  0.0675969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0907  CRISPR-associated protein Cas5 family  53.19 
 
 		 238 aa  272  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2675  CRISPR-associated Cas5 family protein  54.31 
 
 		 238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0831  CRISPR-associated Cas5 family protein  34.57 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.842897  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0944  CRISPR-associated protein Cas5 family  35.71 
 
 		 273 aa  95.1  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0927  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.47 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0985  CRISPR-associated protein Cas5 family  35.67 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0647  CRISPR-associated Cas5 family protein  33.52 
 
 		 262 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0021  CRISPR-associated Cas5e family protein  33.33 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.538245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17320  CRISPR-associated protein, Cas5e family  37.27 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1975  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.49 
 
 		 257 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.40631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1589  CRISPR-associated Cas5e family protein  28.69 
 
 		 254 aa  85.1  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417403  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13900  CRISPR-associated protein Cas5  27.88 
 
 		 236 aa  85.1  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.872767  normal  0.507161 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1899  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.83 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2442  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.36 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17170  CRISPR-associated protein Cas5  28.24 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2683  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.91 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1234  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.3 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00117259  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1597  CRISPR-associated Cas5e family protein  33.16 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0035372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1284  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.28 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3015  Cas5 family CRISPR-associated protein  32.3 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000337648  normal  0.0242997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2339  CRISPR-associated Cas5 family protein  36.02 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1532  Cas5 family CRISPR-associated protein  33.94 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0481133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4090  CRISPR-associated protein Cas5 family  33.75 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.509678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3051  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.68 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000204207  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2576  CRISPR-associated Cas5 family protein  34.52 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0636812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17210  CRISPR-associated protein, CT1976  32.22 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3757  CRISPR-associated Cas5e family protein  36.08 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.364301 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0763  CRISPR system CASCADE complex protein CasD  33.33 
 
 		 291 aa  71.6  0.000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3906  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.09 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00264254  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2633  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.9 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.405174  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0597  CRISPR-associated Cas5e family protein  28.48 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000345339  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2987  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.01 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0861  CRISPR-associated Cas5e family protein  25.64 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0951  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.25 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0906811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2232  CRISPR-associated protein Cas5 family  25 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0932  CRISPR-associated Cas5e family protein  30.11 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.767604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3059  CRISPR-associated Cas5 family protein  24.36 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0230  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.63 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3587  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.19 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4010  CRISPR-associated protein Cas5  24.36 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.74 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  27.38 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3544  CRISPR-associated Cas5 family protein  33.75 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725088 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0401  CRISPR-associated protein Cas5 family  27.06 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0308989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0484  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.21 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.325433  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0171  CRISPR-associated Cas5e family protein  30.06 
 
 		 261 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1388  CRISPR-associated Cas5e family protein  23.77 
 
 		 226 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3150  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.38 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.635269 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2885  CRISPR-associated Cas5 family protein  22.69 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.582573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3094  CRISPR-associated protein Cas5  28.75 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.18699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5411  CRISPR-associated protein Cas5 family  24.34 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0731304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0955  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.11 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2896  CRISPR-associated Cas5 family protein  28.74 
 
 		 226 aa  42.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.586448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0931  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.99 
 
 		 224 aa  42  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>