64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3757 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3757  CRISPR-associated Cas5e family protein  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.364301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17210  CRISPR-associated protein, CT1976  75.8 
 
 		 217 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3015  Cas5 family CRISPR-associated protein  55.74 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000337648  normal  0.0242997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2339  CRISPR-associated Cas5 family protein  52.86 
 
 		 232 aa  214  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1234  CRISPR-associated protein Cas5 family  55.36 
 
 		 232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00117259  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1899  CRISPR-associated protein Cas5 family  50.64 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4090  CRISPR-associated protein Cas5 family  46.23 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.509678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2633  CRISPR-associated Cas5e family protein  49.34 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.405174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2442  CRISPR-associated protein Cas5 family  47.62 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0944  CRISPR-associated protein Cas5 family  51.3 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2683  CRISPR-associated protein Cas5 family  49.38 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3906  CRISPR-associated protein Cas5 family  40.61 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00264254  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2576  CRISPR-associated Cas5 family protein  41.89 
 
 		 238 aa  131  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0636812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3051  CRISPR-associated protein Cas5 family  48.47 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000204207  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17320  CRISPR-associated protein, Cas5e family  40.83 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0647  CRISPR-associated Cas5 family protein  37.01 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1284  CRISPR-associated protein Cas5 family  40.87 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1597  CRISPR-associated Cas5e family protein  47.83 
 
 		 245 aa  124  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0035372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1532  Cas5 family CRISPR-associated protein  41.38 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0481133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2828  hypothetical protein  45.56 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17170  CRISPR-associated protein Cas5  38.84 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0985  CRISPR-associated protein Cas5 family  36.97 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0021  CRISPR-associated Cas5e family protein  35.95 
 
 		 276 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.538245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0763  CRISPR system CASCADE complex protein CasD  40.56 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1975  CRISPR-associated Cas5 family protein  47.97 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.40631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13900  CRISPR-associated protein Cas5  45.21 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.872767  normal  0.507161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1589  CRISPR-associated Cas5e family protein  41.89 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0831  CRISPR-associated Cas5 family protein  41.18 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.842897  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0861  CRISPR-associated Cas5e family protein  36.72 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2675  CRISPR-associated Cas5 family protein  37.8 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0597  CRISPR-associated Cas5e family protein  35.23 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000345339  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2163  CRISPR-associated protein Cas5 family  36.08 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.193051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0907  CRISPR-associated protein Cas5 family  36.97 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1414  CRISPR-associated protein Cas5 family  33.53 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.136655  normal  0.0675969 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0927  CRISPR-associated protein Cas5 family  35.8 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3544  CRISPR-associated Cas5 family protein  35.03 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2476  CRISPR-associated protein Cas5 family  36.67 
 
 		 271 aa  62  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0171  CRISPR-associated Cas5e family protein  33.76 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2987  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.84 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4010  CRISPR-associated protein Cas5  34.67 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.15 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2885  CRISPR-associated Cas5 family protein  34 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.582573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3059  CRISPR-associated Cas5 family protein  34 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0230  CRISPR-associated Cas5e family protein  31.01 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00869  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.1 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0960  hypothetical protein  31.87 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.87 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0484  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.57 
 
 		 252 aa  48.9  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.325433  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5411  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.05 
 
 		 273 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0731304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3587  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.19 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0951  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.7 
 
 		 242 aa  48.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0906811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0955  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.3 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1590  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.46 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.468726 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1604  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.63 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.421198  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2232  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.67 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1388  CRISPR-associated Cas5e family protein  31.71 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2896  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.84 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.586448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0931  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.98 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3068  CRISPR-associated protein Cas5  36.67 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3150  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.75 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.635269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3094  CRISPR-associated protein Cas5  29.11 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.18699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3134  CRISPR-associated protein  36 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3251  CRISPR-associated protein Cas5  36 
 
 		 248 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.696128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1377  CRISPR-associated Cas5e family protein  30.37 
 
 		 225 aa  41.6  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00215137  normal  0.352446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>