61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1284 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1284  CRISPR-associated protein Cas5 family  100 
 
 		 242 aa  474  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1597  CRISPR-associated Cas5e family protein  67.37 
 
 		 245 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0035372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2683  CRISPR-associated protein Cas5 family  64.44 
 
 		 234 aa  288  7e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1532  Cas5 family CRISPR-associated protein  58.47 
 
 		 232 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0481133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3906  CRISPR-associated protein Cas5 family  54.07 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00264254  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2576  CRISPR-associated Cas5 family protein  49.38 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0636812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3051  CRISPR-associated protein Cas5 family  50 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000204207  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17320  CRISPR-associated protein, Cas5e family  45.8 
 
 		 262 aa  168  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0985  CRISPR-associated protein Cas5 family  43.63 
 
 		 253 aa  161  9e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0021  CRISPR-associated Cas5e family protein  42.96 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.538245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17170  CRISPR-associated protein Cas5  39.91 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1975  CRISPR-associated Cas5 family protein  38.26 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.40631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0944  CRISPR-associated protein Cas5 family  35.25 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3757  CRISPR-associated Cas5e family protein  40.87 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.364301 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13900  CRISPR-associated protein Cas5  44.3 
 
 		 236 aa  124  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.872767  normal  0.507161 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1899  CRISPR-associated protein Cas5 family  38.24 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2339  CRISPR-associated Cas5 family protein  38.72 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17210  CRISPR-associated protein, CT1976  48.98 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2633  CRISPR-associated Cas5e family protein  38.79 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.405174  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0763  CRISPR system CASCADE complex protein CasD  37.28 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1234  CRISPR-associated protein Cas5 family  43.35 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00117259  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3015  Cas5 family CRISPR-associated protein  39.01 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000337648  normal  0.0242997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1589  CRISPR-associated Cas5e family protein  35.93 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417403  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0647  CRISPR-associated Cas5 family protein  34.07 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2442  CRISPR-associated protein Cas5 family  44.44 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4090  CRISPR-associated protein Cas5 family  39.29 
 
 		 216 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.509678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0831  CRISPR-associated Cas5 family protein  31 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.842897  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0171  CRISPR-associated Cas5e family protein  37.8 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2163  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.28 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.193051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0907  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.28 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0861  CRISPR-associated Cas5e family protein  31.03 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1414  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.98 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.136655  normal  0.0675969 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0955  CRISPR-associated Cas5 family protein  35.29 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0931  CRISPR-associated protein Cas5 family  34.12 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2896  CRISPR-associated Cas5 family protein  33.91 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.586448  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2675  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.76 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1388  CRISPR-associated Cas5e family protein  30 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0927  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.65 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1590  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.61 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.468726 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0597  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.68 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000345339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1377  CRISPR-associated Cas5e family protein  36.15 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00215137  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2828  hypothetical protein  41.38 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5411  CRISPR-associated protein Cas5 family  35 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0731304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3544  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.37 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2987  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.63 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0230  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.94 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3318  CRISPR-associated Cas5 family protein  28.12 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295879  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1810  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.95 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0951  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.21 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0906811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1604  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.38 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.421198  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0424  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.75 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00796359  normal  0.029859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00869  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.19 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0484  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.19 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.325433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0960  hypothetical protein  28.48 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3059  CRISPR-associated Cas5 family protein  32 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.55 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4010  CRISPR-associated protein Cas5  32 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2885  CRISPR-associated Cas5 family protein  26.55 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.582573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3587  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.72 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.36 
 
 		 246 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2476  CRISPR-associated protein Cas5 family  33.33 
 
 		 271 aa  42  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>