70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3094 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3094  CRISPR-associated protein Cas5  100 
 
 
241 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.18699  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3150  CRISPR-associated Cas5 family protein  99.17 
 
 
241 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.635269 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0401  CRISPR-associated protein Cas5 family  54.2 
 
 
244 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0308989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3587  CRISPR-associated protein Cas5 family  55.37 
 
 
245 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4010  CRISPR-associated protein Cas5  48.95 
 
 
248 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3059  CRISPR-associated Cas5 family protein  47.92 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2885  CRISPR-associated Cas5 family protein  47.5 
 
 
248 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.582573  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3068  CRISPR-associated protein Cas5  50 
 
 
248 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3251  CRISPR-associated protein Cas5  49.58 
 
 
248 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.696128  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3134  CRISPR-associated protein  49.17 
 
 
248 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2476  CRISPR-associated protein Cas5 family  44.11 
 
 
271 aa  171  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0230  CRISPR-associated Cas5e family protein  41.06 
 
 
260 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0597  CRISPR-associated Cas5e family protein  40.34 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000345339  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0960  hypothetical protein  46.41 
 
 
244 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3544  CRISPR-associated Cas5 family protein  42.8 
 
 
258 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0725088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2987  CRISPR-associated Cas5 family protein  38.46 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3117  CRISPR-associated protein Cas5  44.39 
 
 
213 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0861  CRISPR-associated Cas5e family protein  40.17 
 
 
245 aa  141  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1604  CRISPR-associated protein Cas5 family  44.64 
 
 
257 aa  139  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.421198  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0171  CRISPR-associated Cas5e family protein  43.6 
 
 
261 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5411  CRISPR-associated protein Cas5 family  46.3 
 
 
273 aa  118  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0731304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0424  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.79 
 
 
260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00796359  normal  0.029859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00869  CRISPR-associated protein Cas5 family  38.98 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1810  CRISPR-associated Cas5 family protein  33.19 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3318  CRISPR-associated Cas5 family protein  33.19 
 
 
249 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295879  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1377  CRISPR-associated Cas5e family protein  36.2 
 
 
225 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00215137  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2896  CRISPR-associated Cas5 family protein  40.24 
 
 
226 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.586448  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0955  CRISPR-associated Cas5 family protein  39.64 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0931  CRISPR-associated protein Cas5 family  39.64 
 
 
224 aa  89  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0944  CRISPR-associated protein Cas5 family  37.5 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2442  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.94 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844611 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1388  CRISPR-associated Cas5e family protein  42.07 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0647  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.52 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1975  CRISPR-associated Cas5 family protein  32.76 
 
 
257 aa  78.6  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.40631  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0985  CRISPR-associated protein Cas5 family  35.03 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2576  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.21 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0636812 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1590  CRISPR-associated Cas5 family protein  32.67 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.468726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17170  CRISPR-associated protein Cas5  33.33 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0763  CRISPR system CASCADE complex protein CasD  29.12 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0484  CRISPR-associated protein Cas5 family  34.34 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.325433  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0021  CRISPR-associated Cas5e family protein  35.58 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.538245  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4090  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.64 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.509678  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3051  CRISPR-associated protein Cas5 family  34.38 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000204207  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17320  CRISPR-associated protein, Cas5e family  32.93 
 
 
262 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1899  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.19 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2163  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.75 
 
 
233 aa  62  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.193051  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2675  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.71 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2633  CRISPR-associated Cas5e family protein  31.06 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.405174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0831  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.89 
 
 
231 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.842897  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2683  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.57 
 
 
234 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3757  CRISPR-associated Cas5e family protein  31.65 
 
 
220 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.364301 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.46 
 
 
246 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1532  Cas5 family CRISPR-associated protein  31.45 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0481133  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0951  CRISPR-associated Cas5 family protein  32.57 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0906811  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13900  CRISPR-associated protein Cas5  30.39 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.872767  normal  0.507161 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0932  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.65 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.767604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1589  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.87 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417403  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1414  CRISPR-associated protein Cas5 family  27.38 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.136655  normal  0.0675969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3906  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.41 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00264254  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1284  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.79 
 
 
242 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0907  CRISPR-associated protein Cas5 family  27.88 
 
 
238 aa  55.8  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3015  Cas5 family CRISPR-associated protein  30.26 
 
 
231 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000337648  normal  0.0242997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2339  CRISPR-associated Cas5 family protein  28.48 
 
 
232 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  30 
 
 
246 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3218  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.14 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.960254  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2232  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.41 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1234  CRISPR-associated protein Cas5 family  26.97 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00117259  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17210  CRISPR-associated protein, CT1976  29.81 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0927  CRISPR-associated protein Cas5 family  26.97 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1597  CRISPR-associated Cas5e family protein  25 
 
 
245 aa  42  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0035372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>