68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3051 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3051  CRISPR-associated protein Cas5 family  100 
 
 
252 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000204207  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2576  CRISPR-associated Cas5 family protein  46.34 
 
 
238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0636812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1284  CRISPR-associated protein Cas5 family  50 
 
 
242 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1597  CRISPR-associated Cas5e family protein  48.39 
 
 
245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0035372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3906  CRISPR-associated protein Cas5 family  46.61 
 
 
245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00264254  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2683  CRISPR-associated protein Cas5 family  47.11 
 
 
234 aa  191  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1532  Cas5 family CRISPR-associated protein  46.15 
 
 
232 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0481133  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17320  CRISPR-associated protein, Cas5e family  44.77 
 
 
262 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0021  CRISPR-associated Cas5e family protein  40 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.538245  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0985  CRISPR-associated protein Cas5 family  39.03 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0944  CRISPR-associated protein Cas5 family  40.59 
 
 
273 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1899  CRISPR-associated protein Cas5 family  38.19 
 
 
230 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0763  CRISPR system CASCADE complex protein CasD  35.34 
 
 
291 aa  132  7.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17210  CRISPR-associated protein, CT1976  42.79 
 
 
217 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3757  CRISPR-associated Cas5e family protein  48.47 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.364301 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1234  CRISPR-associated protein Cas5 family  39.15 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00117259  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17170  CRISPR-associated protein Cas5  46.36 
 
 
255 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2339  CRISPR-associated Cas5 family protein  43.75 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1975  CRISPR-associated Cas5 family protein  37.45 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.40631  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2633  CRISPR-associated Cas5e family protein  47.47 
 
 
232 aa  125  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.405174  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3015  Cas5 family CRISPR-associated protein  45.91 
 
 
231 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000337648  normal  0.0242997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13900  CRISPR-associated protein Cas5  40.99 
 
 
236 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.872767  normal  0.507161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0647  CRISPR-associated Cas5 family protein  39.55 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4090  CRISPR-associated protein Cas5 family  40.38 
 
 
216 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.509678  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1589  CRISPR-associated Cas5e family protein  37.55 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2442  CRISPR-associated protein Cas5 family  41.67 
 
 
215 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844611 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0831  CRISPR-associated Cas5 family protein  37.25 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.842897  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2987  CRISPR-associated Cas5 family protein  36.2 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0171  CRISPR-associated Cas5e family protein  36.65 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0597  CRISPR-associated Cas5e family protein  34.78 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000345339  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0927  CRISPR-associated protein Cas5 family  33.54 
 
 
249 aa  79  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0907  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.54 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2163  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.68 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.193051  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2675  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.76 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0230  CRISPR-associated Cas5e family protein  36.94 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1414  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.18 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.136655  normal  0.0675969 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2828  hypothetical protein  41.35 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0861  CRISPR-associated Cas5e family protein  36.48 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3544  CRISPR-associated Cas5 family protein  37.91 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0725088 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1377  CRISPR-associated Cas5e family protein  35.66 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00215137  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0955  CRISPR-associated Cas5 family protein  30.81 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0960  hypothetical protein  38.75 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0931  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.95 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2896  CRISPR-associated Cas5 family protein  30.48 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.586448  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1590  CRISPR-associated Cas5 family protein  30.56 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.468726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5411  CRISPR-associated protein Cas5 family  33.71 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0731304  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0951  CRISPR-associated Cas5 family protein  32.1 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0906811  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2476  CRISPR-associated protein Cas5 family  35.61 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1604  CRISPR-associated protein Cas5 family  36.87 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.421198  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4010  CRISPR-associated protein Cas5  34.87 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3059  CRISPR-associated Cas5 family protein  34.87 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1810  CRISPR-associated Cas5 family protein  32.72 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3318  CRISPR-associated Cas5 family protein  32.92 
 
 
249 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1388  CRISPR-associated Cas5e family protein  36.42 
 
 
226 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2885  CRISPR-associated Cas5 family protein  34.21 
 
 
248 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.582573  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3587  CRISPR-associated protein Cas5 family  38.27 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00869  CRISPR-associated protein Cas5 family  36.91 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2232  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.31 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  33.95 
 
 
246 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0424  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.25 
 
 
260 aa  55.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00796359  normal  0.029859 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0401  CRISPR-associated protein Cas5 family  35.58 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0308989  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3218  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.57 
 
 
228 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.960254  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0484  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.72 
 
 
252 aa  49.3  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.325433  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.1 
 
 
246 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3150  CRISPR-associated Cas5 family protein  34.38 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.635269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3094  CRISPR-associated protein Cas5  34.38 
 
 
241 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.18699  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0932  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.83 
 
 
249 aa  42.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.767604  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1814  CRISPR-associated Cas5 family protein  39.47 
 
 
238 aa  42.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>