37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3201 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3201  CRISPR-associated protein Cas5 family  100 
 
 		 253 aa  502  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2232  CRISPR-associated protein Cas5 family  41.46 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3218  CRISPR-associated protein Cas5 family  42.56 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.960254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0345  CRISPR-associated Cas5e family protein  45.11 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  43.15 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  43.15 
 
 		 246 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0932  CRISPR-associated Cas5e family protein  36.55 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.767604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0484  CRISPR-associated protein Cas5 family  42.08 
 
 		 252 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.325433  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0951  CRISPR-associated Cas5 family protein  36.29 
 
 		 242 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0906811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2442  CRISPR-associated protein Cas5 family  33.54 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0597  CRISPR-associated Cas5e family protein  24.31 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000345339  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0230  CRISPR-associated Cas5e family protein  31.21 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2987  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.22 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0171  CRISPR-associated Cas5e family protein  30.43 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2339  CRISPR-associated Cas5 family protein  34.29 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1899  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.08 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17170  CRISPR-associated protein Cas5  31.25 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0647  CRISPR-associated Cas5 family protein  32.14 
 
 		 262 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3015  Cas5 family CRISPR-associated protein  32.22 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000337648  normal  0.0242997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3544  CRISPR-associated Cas5 family protein  25.48 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725088 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00869  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.91 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1590  CRISPR-associated Cas5 family protein  22.22 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.468726 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0960  hypothetical protein  31.85 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5411  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.97 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0731304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17320  CRISPR-associated protein, Cas5e family  29.09 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2633  CRISPR-associated Cas5e family protein  36.25 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.405174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2683  CRISPR-associated protein Cas5 family  34.16 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3059  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.11 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4010  CRISPR-associated protein Cas5  29.11 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1414  CRISPR-associated protein Cas5 family  27.51 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.136655  normal  0.0675969 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0985  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.93 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1597  CRISPR-associated Cas5e family protein  31.68 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0035372  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3051  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.89 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000204207  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1234  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.11 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00117259  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2675  CRISPR-associated Cas5 family protein  28.24 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3906  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.75 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00264254  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2476  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.77 
 
 		 271 aa  42  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>