48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3117 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3117  CRISPR-associated protein Cas5  100 
 
 		 213 aa  443  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3059  CRISPR-associated Cas5 family protein  96.24 
 
 		 248 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2885  CRISPR-associated Cas5 family protein  95.31 
 
 		 248 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.582573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4010  CRISPR-associated protein Cas5  94.37 
 
 		 248 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3068  CRISPR-associated protein Cas5  79.31 
 
 		 248 aa  321  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3251  CRISPR-associated protein Cas5  78.82 
 
 		 248 aa  318  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.696128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3134  CRISPR-associated protein  78.33 
 
 		 248 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3094  CRISPR-associated protein Cas5  43.08 
 
 		 241 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.18699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3150  CRISPR-associated Cas5 family protein  42.56 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.635269 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0401  CRISPR-associated protein Cas5 family  43.08 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0308989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3587  CRISPR-associated protein Cas5 family  43.43 
 
 		 245 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0230  CRISPR-associated Cas5e family protein  37.96 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0960  hypothetical protein  38.46 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0597  CRISPR-associated Cas5e family protein  34.33 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000345339  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1604  CRISPR-associated protein Cas5 family  39.38 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.421198  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2476  CRISPR-associated protein Cas5 family  36.87 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3544  CRISPR-associated Cas5 family protein  37.98 
 
 		 258 aa  99.4  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725088 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00869  CRISPR-associated protein Cas5 family  35.47 
 
 		 231 aa  99.4  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1810  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.88 
 
 		 249 aa  98.6  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3318  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.88 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295879  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0424  CRISPR-associated protein Cas5 family  34.11 
 
 		 260 aa  93.2  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00796359  normal  0.029859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0171  CRISPR-associated Cas5e family protein  37.32 
 
 		 261 aa  92.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0861  CRISPR-associated Cas5e family protein  33.5 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2987  CRISPR-associated Cas5 family protein  33.03 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1377  CRISPR-associated Cas5e family protein  33.17 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00215137  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5411  CRISPR-associated protein Cas5 family  42.42 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0731304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1388  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.38 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0944  CRISPR-associated protein Cas5 family  37.12 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0484  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.67 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.325433  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1590  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.21 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.468726 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0951  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.78 
 
 		 242 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0906811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2442  CRISPR-associated protein Cas5 family  27 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844611 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0985  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.52 
 
 		 253 aa  48.9  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4090  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.07 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.509678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0647  CRISPR-associated Cas5 family protein  26.04 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17320  CRISPR-associated protein, Cas5e family  30.67 
 
 		 262 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.38 
 
 		 246 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0021  CRISPR-associated Cas5e family protein  32.64 
 
 		 276 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.538245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0955  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.27 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0932  CRISPR-associated Cas5e family protein  28.36 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.767604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2896  CRISPR-associated Cas5 family protein  28.46 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.586448  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.86 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17210  CRISPR-associated protein, CT1976  32.17 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0931  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.27 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2576  CRISPR-associated Cas5 family protein  28.57 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0636812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3051  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.56 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000204207  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13900  CRISPR-associated protein Cas5  31.34 
 
 		 236 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.872767  normal  0.507161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1975  CRISPR-associated Cas5 family protein  30.71 
 
 		 257 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.40631  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>