More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4135 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4135  ABC transporter permease  100 
 
 
214 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47950  ABC transporter permease  98.6 
 
 
214 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.274179  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3866  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.41 
 
 
217 aa  242  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.680924  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4862  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.93 
 
 
217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1515  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  41.63 
 
 
216 aa  174  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00992032  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1027  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
223 aa  165  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
216 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.62 
 
 
216 aa  126  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  33.5 
 
 
216 aa  126  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  37.44 
 
 
216 aa  125  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
216 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  31.63 
 
 
727 aa  121  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3951  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36 
 
 
221 aa  119  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.365778 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5458  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  35.21 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.07 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1707  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.22 
 
 
219 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.16 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.62 
 
 
222 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.81 
 
 
221 aa  112  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.571407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.47 
 
 
492 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  30.36 
 
 
714 aa  111  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.99 
 
 
493 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1802  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.12 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.728657  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.07 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4063  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.98 
 
 
216 aa  108  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  32.09 
 
 
736 aa  107  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0553  glutamine ABC transporter permease  33.18 
 
 
214 aa  106  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0609  amino acid ABC transporter permease  33.18 
 
 
214 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00355475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0554  glutamine ABC transporter permease  33.18 
 
 
214 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0642  amino acid ABC transporter permease  33.18 
 
 
214 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00728334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0678  amino acid ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 
214 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4636  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.16 
 
 
213 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1657  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.92 
 
 
223 aa  104  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000259788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3462  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.22 
 
 
216 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6679  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.47 
 
 
215 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0230  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.84 
 
 
221 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3398  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.53 
 
 
226 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0376  amino acid ABC transporter permease  35.78 
 
 
319 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0699  amino acid ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 
214 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7225  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  36.68 
 
 
219 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1570  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.52 
 
 
219 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.324967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0555  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.71 
 
 
214 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0234  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.34 
 
 
221 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.17 
 
 
216 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2183  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.71 
 
 
217 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  36.95 
 
 
223 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4660  amino acid ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
214 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  hitchhiker  1.97521e-21 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3743  amino acid ABC transporter permease  35.51 
 
 
217 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.870157  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5260  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.35 
 
 
219 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.571687  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2509  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.68 
 
 
219 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0710  amino acid ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 
214 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3090  amino acid ABC transporter permease  30.85 
 
 
220 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0655  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  30.77 
 
 
490 aa  102  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.76 
 
 
485 aa  102  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.76 
 
 
485 aa  102  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.68 
 
 
219 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2290  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.85 
 
 
219 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  29.85 
 
 
485 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7088  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.86 
 
 
213 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2513  amino acid ABC transporter, permease protein  37.09 
 
 
274 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.86 
 
 
219 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221978  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3902  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.2 
 
 
222 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658938  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3699  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.84 
 
 
221 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5966  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  33.82 
 
 
213 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0936885  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0406  ABC transporter permease  33.83 
 
 
230 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2777  amino acid ABC transporter, permease protein  29.59 
 
 
220 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1807  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  36.62 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3004  polar amino acid ABC transporter permease  33.01 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2004  polar amino acid ABC transporter permease  33.01 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.695709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1255  amino acid ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2135  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  33.01 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2505  amino acid ABC transporter permease  29.65 
 
 
220 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0032626  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0776  polar amino acid ABC transporter permease  33.01 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1976  amino acid ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 
230 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3092  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  33.01 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2454  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.99 
 
 
239 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1823  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  36.62 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118724  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0396  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  36.62 
 
 
230 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0766  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  36.62 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0399907  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1738  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  36.62 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.094824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2610  polar amino acid ABC transporter permease  33.01 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0402  amino acid ABC transporter permease  35.03 
 
 
273 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5220  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33 
 
 
219 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.1 
 
 
337 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3108  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.63 
 
 
214 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.03 
 
 
221 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0639  amino acid ABC transporter, permease protein  38.96 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3137  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.68 
 
 
226 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.490493  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0683  amino acid ABC transporter, permease protein  38.96 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3057  polar amino acid ABC transporter permease  33.01 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0342  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.24 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6446  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.5 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0217915 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5948  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.73 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518149  normal  0.0212185 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4548  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.35 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5538  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.35 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.172396 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0835  amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.21 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932034 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.63 
 
 
218 aa  99  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0967  amino acid ABC transporter permease  30.69 
 
 
222 aa  99  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.027607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2943  amino acid ABC transporter permease  31.53 
 
 
219 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627929  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3836  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.07 
 
 
226 aa  98.6  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>