More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47950 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_47950  ABC transporter permease  100 
 
 
214 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.274179  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4135  ABC transporter permease  98.6 
 
 
214 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3866  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.35 
 
 
217 aa  248  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.680924  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4862  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.39 
 
 
217 aa  221  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1515  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  41.63 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00992032  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1027  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.24 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  33.98 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.62 
 
 
216 aa  125  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.24 
 
 
216 aa  124  9e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  36.97 
 
 
216 aa  122  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3951  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.365778 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  31.63 
 
 
727 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5458  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  35.68 
 
 
216 aa  118  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.63 
 
 
221 aa  117  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.6 
 
 
216 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1707  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.73 
 
 
219 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.96 
 
 
492 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.62 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.48 
 
 
493 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4063  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
216 aa  111  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.35 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.571407  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1802  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.12 
 
 
216 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.728657  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  29.91 
 
 
714 aa  109  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.56 
 
 
226 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1657  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.4 
 
 
223 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000259788  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1570  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.01 
 
 
219 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.324967 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4636  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.65 
 
 
213 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  31.63 
 
 
736 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3462  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.71 
 
 
216 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0553  glutamine ABC transporter permease  33.18 
 
 
214 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6679  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.98 
 
 
215 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0609  amino acid ABC transporter permease  33.18 
 
 
214 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00355475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0554  glutamine ABC transporter permease  33.18 
 
 
214 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0642  amino acid ABC transporter permease  33.18 
 
 
214 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00728334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0678  amino acid ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 
214 aa  104  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.66 
 
 
216 aa  104  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0699  amino acid ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 
214 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0376  amino acid ABC transporter permease  35.78 
 
 
319 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7088  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
213 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0406  ABC transporter permease  34.33 
 
 
230 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5948  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.21 
 
 
213 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518149  normal  0.0212185 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0342  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.22 
 
 
219 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2290  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.01 
 
 
219 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3398  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.53 
 
 
226 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0555  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.71 
 
 
214 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3902  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.72 
 
 
222 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658938  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5966  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  34.31 
 
 
213 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0936885  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  36.95 
 
 
223 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4660  amino acid ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
214 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  hitchhiker  1.97521e-21 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3108  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.12 
 
 
214 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0230  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
221 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7225  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  36.18 
 
 
219 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3743  amino acid ABC transporter permease  35.05 
 
 
217 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.870157  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5260  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.85 
 
 
219 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.571687  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6446  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33 
 
 
213 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0217915 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0639  amino acid ABC transporter, permease protein  39.35 
 
 
226 aa  101  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0683  amino acid ABC transporter, permease protein  39.35 
 
 
226 aa  101  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2509  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.21 
 
 
219 aa  101  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0710  amino acid ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 
214 aa  101  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5220  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33 
 
 
219 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2183  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.71 
 
 
217 aa  101  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0234  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.84 
 
 
221 aa  101  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  29.85 
 
 
485 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2454  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.99 
 
 
239 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0309  amino acid ABC transporter permease  33.81 
 
 
229 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000829605  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.27 
 
 
485 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.27 
 
 
485 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  33.62 
 
 
237 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.03 
 
 
221 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0655  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  30.77 
 
 
490 aa  100  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.21 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2610  polar amino acid ABC transporter permease  33.01 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703731  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2004  polar amino acid ABC transporter permease  33.01 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.695709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2135  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  33.01 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3057  polar amino acid ABC transporter permease  33.01 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2943  amino acid ABC transporter permease  31.53 
 
 
219 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627929  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3092  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  33.01 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3090  amino acid ABC transporter permease  30.35 
 
 
220 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0185  amino acid ABC transporter permease  30.77 
 
 
222 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1570  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.9 
 
 
226 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0402  amino acid ABC transporter permease  35.03 
 
 
273 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0776  polar amino acid ABC transporter permease  33.01 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3004  polar amino acid ABC transporter permease  33.01 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04080  putative permease of ABC transporter  33.83 
 
 
230 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2777  amino acid ABC transporter, permease protein  29.8 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2697  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.55 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817852  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0835  amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.21 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5893  ABC transporter permease  33.49 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.575763  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2513  amino acid ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 
274 aa  99.8  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2032  amino acid ABC transporter permease  32.32 
 
 
220 aa  99.4  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.83 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3747  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.88 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0500  amino acid ABC transporter permease  34.95 
 
 
242 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.88 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.39 
 
 
219 aa  99  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221978  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0766  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  36.15 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0399907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1823  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  36.15 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4914  amino acid ABC transporter permease  34.95 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2234  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.29 
 
 
255 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>