More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0821 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0821  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
130 aa  266  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0770966  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1032  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.5 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.74 
 
 
189 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0052  formyl transferase domain protein  42.2 
 
 
182 aa  99  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1136  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.82 
 
 
189 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1109  formyl transferase domain protein  42.98 
 
 
181 aa  95.5  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0810  formyl transferase domain protein  47.37 
 
 
192 aa  93.6  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.18 
 
 
200 aa  92  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304229  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0674  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.81 
 
 
204 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0530  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.98 
 
 
188 aa  91.3  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0676  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.83 
 
 
204 aa  90.1  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0431  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.83 
 
 
200 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4818  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.29 
 
 
193 aa  88.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.519157  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2482  formyl transferase domain protein  41.84 
 
 
189 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.712391  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1765  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.17 
 
 
204 aa  87.4  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.916451  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1766  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.57 
 
 
193 aa  87.4  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0524  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.84 
 
 
204 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0719  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.95 
 
 
193 aa  85.1  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1295  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.41 
 
 
204 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.295392  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.51 
 
 
222 aa  84.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1778  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.93 
 
 
192 aa  83.6  9e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2279  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.64 
 
 
200 aa  83.6  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.38 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03155  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.53 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1929  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.12 
 
 
215 aa  82  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1978  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40 
 
 
212 aa  82  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0264  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.19 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1020  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.23 
 
 
197 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1546  formyl transferase-like protein  36.73 
 
 
190 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.37 
 
 
200 aa  80.9  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.489442  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.23 
 
 
207 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1699  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.78 
 
 
216 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26745  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.36 
 
 
200 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301418 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.74 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0218  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.38 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0909  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.94 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3690  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.78 
 
 
216 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.864702  decreased coverage  0.000250374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09681  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.94 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1644  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.83 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1637  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.83 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.06 
 
 
213 aa  77  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.65 
 
 
216 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.09 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1617  Formyl transferase-like  40.78 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.27 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1441  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.58 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47067  predicted protein  37.27 
 
 
1237 aa  75.9  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.375267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.71 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.04 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.13 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519316  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0898  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.91 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.414511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1446  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.78 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.76 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1407  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.77 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3310  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.56 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  38.38 
 
 
317 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0791  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.94 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277928  normal  0.560587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.03 
 
 
315 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4216  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.14 
 
 
217 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.298326  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6266  predicted protein  34.15 
 
 
206 aa  73.9  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00248936  normal  0.275546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0656  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.45 
 
 
216 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
217 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2182  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
207 aa  73.9  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0319  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.45 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.0027967  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1572  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.94 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09921  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.45 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1844  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.78 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000807934  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1523  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.94 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.04 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4711  formyl transferase domain protein  31.75 
 
 
325 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00446668  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09731  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.46 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.372545  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1837  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.66 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.117962 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002780  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.45 
 
 
220 aa  72  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0457  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.85 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.66 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1421  formyl transferase domain protein  34.21 
 
 
324 aa  71.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.97 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.53 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2095  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.73 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000370583  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.69 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.65 
 
 
218 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135509  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1888  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.77 
 
 
197 aa  72  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00391405  normal  0.23878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0654  formyl transferase domain protein  33.63 
 
 
316 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3067  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.13 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2381  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0156868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2453  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0349529  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.03 
 
 
205 aa  71.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2546  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000131759  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1068  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.89 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2745  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.04 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000377179  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0383  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.25 
 
 
202 aa  71.2  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.68 
 
 
212 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.39 
 
 
188 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1132  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.39 
 
 
188 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.731363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>