More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0490 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
216 aa  420  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  75.62 
 
 
219 aa  300  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5548  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  72.77 
 
 
220 aa  298  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5165  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  73.71 
 
 
218 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820799  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2337  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  75.66 
 
 
219 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2062  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  75.13 
 
 
219 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  61 
 
 
222 aa  242  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.5 
 
 
224 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.39 
 
 
214 aa  239  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.39 
 
 
216 aa  239  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3853  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.18 
 
 
220 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0964  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.83 
 
 
218 aa  229  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.62 
 
 
216 aa  227  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0236  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.64 
 
 
212 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.822796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1967  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.5 
 
 
236 aa  222  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0785  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.29 
 
 
220 aa  221  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160821 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5842  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.79 
 
 
220 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2535  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.79 
 
 
220 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0808214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1899  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.29 
 
 
220 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2510  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.29 
 
 
220 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1598  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.96 
 
 
217 aa  215  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.718303  normal  0.398382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2428  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.28 
 
 
220 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  hitchhiker  0.000000443644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.28 
 
 
220 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.68 
 
 
217 aa  214  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.29 
 
 
222 aa  213  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.93 
 
 
211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.226239  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3462  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.44 
 
 
217 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19888  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.65 
 
 
209 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.77 
 
 
222 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.77 
 
 
222 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.01 
 
 
216 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2488  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.1 
 
 
218 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.062829  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.68 
 
 
220 aa  208  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.07 
 
 
216 aa  207  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.95 
 
 
221 aa  207  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2956  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.14 
 
 
215 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.502503  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1888  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.03 
 
 
197 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00391405  normal  0.23878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.21 
 
 
215 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.15 
 
 
223 aa  205  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.01 
 
 
218 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.79 
 
 
229 aa  205  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.19 
 
 
220 aa  204  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0740  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.69 
 
 
209 aa  204  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.87 
 
 
212 aa  204  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.87 
 
 
212 aa  204  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.87 
 
 
212 aa  204  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0709  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.16 
 
 
205 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.16 
 
 
205 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.5 
 
 
216 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.97 
 
 
216 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.96 
 
 
214 aa  202  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.23 
 
 
226 aa  201  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.68 
 
 
223 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000502279 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2538  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.93 
 
 
206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.49 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1837  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.92 
 
 
197 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.117962 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0913  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.33 
 
 
210 aa  199  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.43 
 
 
217 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.28 
 
 
210 aa  197  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.94 
 
 
217 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.4 
 
 
203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3927  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  59.89 
 
 
198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2618  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.03 
 
 
212 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.46 
 
 
217 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0893  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.45 
 
 
219 aa  194  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000873186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.5 
 
 
220 aa  194  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.81 
 
 
213 aa  194  9e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.28 
 
 
216 aa  193  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0772  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.79 
 
 
220 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.19 
 
 
223 aa  193  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.97 
 
 
213 aa  193  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0969  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.49 
 
 
220 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2110  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.49 
 
 
220 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487388  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.49 
 
 
220 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0973  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.49 
 
 
220 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1031  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.49 
 
 
220 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.723337  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2656  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.49 
 
 
220 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.682807  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3690  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.74 
 
 
216 aa  191  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.864702  decreased coverage  0.000250374 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.97 
 
 
218 aa  191  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135509  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0033  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.74 
 
 
192 aa  191  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.519316  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1824  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.17 
 
 
218 aa  191  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00661254  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.6 
 
 
214 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0552  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1126  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.56 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.49 
 
 
215 aa  188  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.94 
 
 
217 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2544  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  56.99 
 
 
193 aa  188  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.715033  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0791  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.72 
 
 
220 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277928  normal  0.560587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2325  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  58.88 
 
 
218 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.598595  normal  0.961188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1451  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.86 
 
 
214 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00170053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3525  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.26 
 
 
212 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0302516  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1699  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.75 
 
 
216 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26745  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.9 
 
 
203 aa  186  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.94 
 
 
209 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.5 
 
 
217 aa  185  4e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3843  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  52.78 
 
 
199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0791842  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2095  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.39 
 
 
213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000370583  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.21 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0073  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.73 
 
 
219 aa  182  3e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1758  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54.1 
 
 
315 aa  182  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>